在從伊豆回來的路上，因?yàn)樾∥謇傻能囎映隽斯收希履系热私枳URON健康器具公司的山莊。而此時(shí)，山莊里的3人正在新制品藥物社內(nèi)研究的關(guān)鍵時(shí)刻。第三開發(fā)部部長(zhǎng)平松正樹的制品馬上就要被采用了，然而社長(zhǎng)梅谷四郎被刀刺傷，并平松也遭遇車禍身亡。看似事故的現(xiàn)場(chǎng)柯南卻有著不一樣的看法。

幸運(yùn)的是兩人都沒有受傷，演出也能順利進(jìn)行。然而，就在大家驚訝于華麗的舞臺(tái)和逼真的場(chǎng)景時(shí)，煙霧繚繞劇場(chǎng)內(nèi)卻發(fā)生了命案，死者是話劇的男主角，案發(fā)時(shí)，新一立刻跑到舞臺(tái)上并在那里發(fā)現(xiàn)了手槍和空彈殼，之后又想起了出現(xiàn)在舞臺(tái)上的紅色瞄準(zhǔn)線，但他卻不認(rèn)為兇手是從觀眾席殺人，反而肯定兇手當(dāng)時(shí)就在舞臺(tái)上，而嫌疑最大的就是和男主角糾纏不清的四名女演員。

終于到了正式盜取“藍(lán)色奇跡”這一天，鈴木博物館附近被人圍的水泄不通，而且次郎吉也加派了更多的直升機(jī)，柯南在樓頂?shù)却鲁霈F(xiàn)的時(shí)候發(fā)現(xiàn)樓上有兩道新的刮痕，這時(shí)，基德如約而至，雖然突降大雨但這絲毫沒有造成任何影響，看著基德一步步接近寶石，次郎吉卻淡定的說自己早有防備，他到底有何計(jì)劃？基德能否成功盜取寶石并順利脫身？柯南又會(huì)有什么樣的行動(dòng)？

就在警方和小五郎集中精力思考兇手是如何調(diào)換毛巾時(shí)，柯南卻重返飯桌，回憶當(dāng)時(shí)自己為拿醬油和辣油轉(zhuǎn)旋轉(zhuǎn)桌面時(shí)的場(chǎng)景，這時(shí)他突然想到或許兇手根本就不是用有毒毛巾殺人的可能，在向鑒識(shí)人員確認(rèn)了自己的想法后，兇手浮出水面，他讓所有人都按照案發(fā)時(shí)的位置做好，并重現(xiàn)當(dāng)時(shí)的場(chǎng)景，而兇手卻在不知不覺間自己露出了馬腳。

警察雖然推斷巖夫是自殺，但柯南卻發(fā)現(xiàn)了眾多的疑點(diǎn)。而從尸體嘴里流血的事實(shí)，燈繩上可疑的繩結(jié)和小蘭的敘述中柯南最終推理出了犯人的犯罪手法。但是，就在柯南要揭露兇手的關(guān)鍵時(shí)刻卻因?yàn)楦忻安荒馨l(fā)聲了！沒有其他辦法，柯南通過不斷的比劃的猜謎來引導(dǎo)眾人來尋找兇手的線索，最終犯人的身份揭曉。而兇手也承認(rèn)因?yàn)槠拮拥挠龊Χ鴼⑺辣缓φ叩氖聦?shí)。