阿笠博士住在鄉(xiāng)下的老友龍?zhí)赡抢飫偤糜性麄兿胍纳钌介毙蜗x(chóng)，在柯南等人捉蟲(chóng)回來(lái)時(shí)卻發(fā)現(xiàn)龍?zhí)纱笫宓乖诹说厣希T(mén)口的佛像也不翼而飛，再留下“深山楸形”幾個(gè)字后龍?zhí)杀銜灹诉^(guò)去。與龍?zhí)捎型恋剡吔鐔?wèn)題糾紛的周平和時(shí)常會(huì)偷盜佛像的慶都因與“深山楸形蟲(chóng)”有關(guān)系而被懷疑，經(jīng)過(guò)調(diào)查而前往道之站的柯南認(rèn)為兇手另有其人。

阿笠博士為了鑒定古董壺的價(jià)值而在影音網(wǎng)站上傳了影像，沒(méi)想到卻引起了這次的綁架事件。就在柯南等人重新購(gòu)買(mǎi)咖喱食材的那段時(shí)間內(nèi)，在家里的阿笠博士被電暈，而和博士在一起的步美也被綁架了，而綁架犯的目標(biāo)卻是讓柯南他們尋找簡(jiǎn)訊中的貓，在柯南等人來(lái)回奔波時(shí)綁架犯又發(fā)來(lái)了訊息，聲稱(chēng)找到貓的綁架犯釋放了步美，但他們的真正目的到底是什么？

八號(hào)車(chē)廂里的殺人事件已經(jīng)偵破，而有希子與苦艾酒的對(duì)峙還沒(méi)有結(jié)束，在八號(hào)車(chē)廂制造火災(zāi)假象后等待著小哀的是波本。與苦艾酒所計(jì)劃的一樣，隨著列車(chē)的爆炸苦艾酒的任務(wù)也告一段落，正在品味勝利成果的她卻又看到了和少年偵探團(tuán)一起的小哀，這一切的背后還有所隱藏，前來(lái)協(xié)助柯南的究竟是何方神圣？

受百合香小姐之邀小五郎帶著小蘭和柯南前往了葡萄園，在那里他們看到了前來(lái)簽合同的山口先生，而百合香小姐的丈夫健吾卻帶著契約不知所蹤。水町帶來(lái)的契約上已經(jīng)有了健吾的簽名，在水町帶著小五郎等人參觀葡萄園時(shí)百合香小姐依舊沒(méi)能找到自己的丈夫，他們一起前往酒庫(kù)后才發(fā)現(xiàn)健吾已經(jīng)遇害，而除了水町之外其他的人都有不在場(chǎng)的證明。

少年偵探團(tuán)利用連休來(lái)到了京都，他們是為了乘坐神盾艦體驗(yàn)航海的樂(lè)趣，但跟著他們一起前來(lái)的園子、小蘭和小五郎卻對(duì)小吃和酒更感興趣。京都的日式甜點(diǎn)是小蘭非常喜歡的甜點(diǎn)，但她購(gòu)買(mǎi)的老店中卻沒(méi)有了巧克力口味，慌忙跑進(jìn)來(lái)的社長(zhǎng)竟然稱(chēng)所有分店的巧克力口味都憑空消失了，聽(tīng)到小五郎名號(hào)的社長(zhǎng)急忙拜托調(diào)查。