"2007年夏，2008年北京奧運會各項籌備工作都在緊張地進行。偌大的城市中，一位因為發(fā)現(xiàn)物理學不存在而信仰崩塌的女人自殺了，她叫做楊冬，是一個很有名的物理學家。警方通過取證判定，是由于過量服用安眠藥死亡。很快，現(xiàn)場被軍方接管了。警方隊長史強依然鎮(zhèn)定自若地坐在車里玩貪吃蛇，而配合調查的幾名科學家需要他們親自去請。楊冬事件令科學界惋惜，近兩年來已有數(shù)名科學家因自殺離世，這對于科學界可謂是一場巨大的災難。接觸科學節(jié)目特地邀請了著名生物學家潘寒，他曾成功預言轉基因作物造成的生態(tài)災難，他始終認為科技的過度發(fā)展是人類社會的一種病變，技術爆炸性發(fā)展就像癌細胞一樣飛速擴散，最終都是導致其寄宿體的死亡，如果地球毀滅的話，誰又能幸免。史強和軍方去了汪淼家中，剛開門就被提醒這里不能抽煙。史強想要了解的是汪淼和科學邊界學會成員接觸一事，汪淼愣了一下，回想起一些畫面后緩緩開口，科學邊界是國際學術界一個很有影響力的學術組織，它的成員都是知名學者。汪淼強調它是合法的，他為什么不能接觸呢？史強勉強地笑了笑，他并沒有說這是不合法的。汪淼表示自己有權不回答他的問題便要關門，被史強強硬阻止，汪淼有些不滿。史強連忙被拉走了

趙顯的母親希望他和冬曉結婚前簽一份婚前協(xié)議書，冬曉認為這合情合理，趙顯擬好后給她看一下就可以。付心童每天重復同樣的生活，此刻有些感慨，邊亮打算等邊小方的成績出來以后帶她好好出去轉轉，不過付心童也沒什么心思。邊亮說明天要請公司新來的小孩兒吃個飯，讓付心童準備一下。被裁撤的店長被重新錄用了，邊亮希望文草草能夠避嫌，不過文草草覺得事情已經傳得沸沸揚揚了，她也沒什么避嫌的必要了，還不如按她想的去做。邊亮讓文草草晚上來家里吃個飯，文草草下班后特地去做了發(fā)型買了份蛋糕，之后就去了邊亮家。付心童見只有文草草一個人很納悶，尤其邊亮喝醉過還喊過她的名字。吃飯的時候，邊亮總是表現(xiàn)出對付心童的關心愛護，讓付心童都覺得有些詫異。付心童問文草草有沒有男朋友，文草草如實回答自己單身，住在公司宿舍里。吃過晚飯后，邊亮拿了一個文草草買的芒果蛋糕給付心童，但是她并沒有吃，邊亮稍后才反應過來付心童芒果過敏。邊亮送文草草離開時，文草草已經一眼看出邊亮今天就是為了演戲而已，想要讓她知難而退，但文草草認為自己的愛可以是單方面不求回報的，她的愛與邊亮無關。回到家，付心童也沒怎么理會邊亮。裝修老房子的時候，付心童和李漫說起文草草來

史強被一輛摩托車撞到了，車主叫做慕星，是一個媒體人，前兩天注意到了史強被停職的事情，而且她也在調查科學家自殺的事情，希望和他合作。史強沒有理會，關掉了她隨身攜帶的錄音筆就離開了。汪淼去了基地，見到了葉文潔的學生沙瑞山。申玉菲所說的“整個宇宙將為你閃爍”，沙瑞山認為這是一個玩笑，就算世界末日也不會發(fā)生。但如果真的出現(xiàn)什么波動，也確實值得記錄下來。汪淼靜靜地等待凌晨一點，時間越來越近，只剩下不到一分鐘。凌晨一點整，沙瑞山所說的綠色波動變成了紅色，沙瑞山一開始以為是機器故障，直到他發(fā)現(xiàn)另外兩臺也是如此。沙瑞山不愿相信徹底瘋狂起來，但他和汪淼不得不相信，是宇宙在閃爍！汪淼讓沙瑞山把那些紅色曲線打印出來，根據(jù)摩斯密碼破解出的數(shù)字告訴他，還剩一千一百零八個小時。四十七分鐘過去宇宙已經在閃爍，沙瑞山告訴汪淼可以用三K眼鏡看到這一切。沙瑞山知道汪淼一定知道自己很多不知道的事情，也希望他能把知道的告訴自己，但汪淼告訴他宇宙閃爍在凌晨五點就會結束，他不必深究。汪淼一路飆車去了天文館，拿到了沙瑞山讓人送來的三K眼鏡。打開開關那一刻，汪淼清清楚楚地看到眼前的一切散發(fā)著紅色的光，最后匯聚成了一串倒計時向他逼近。

史強的方案得到了眾人一致認可，常偉思布置了這次行動的具體安排，亞洲戰(zhàn)區(qū)作為這次行動的總指揮。汪淼和納米中心將全權負責這次行動的技術支持，這次行動被命名為古箏行動。來到巴拿馬作戰(zhàn)區(qū)，汪淼很擔心這次行動會傷及無辜，畢竟船上的船員也不知道他們在做什么。不過很快汪淼就得知，這船上的人可以說是窮兇極惡，滿滿全是恐怖分子，甚至還有人殘忍地殺害過軍官的孩子，此刻在船上，恩佐殺害了一個想上岸的人，就像殺害那個孩子一樣開膛破肚，然后留下一句話：這是對你的救贖。審判日號每天都在往河里扔尸體，就像扔垃圾一樣平常。古箏和這次的行動很貼切，利用納米材質的飛刃在審判日號將度過的河邊支撐，形成殺人于無形的利器。審判日號距離琴的距離越來越近，汪淼拿著望遠鏡緊張地盯著不遠處，這里所有人都很緊張，進入了二十秒倒計時。指揮官告訴汪淼，一切都很快會過去，不用擔心。審判日號開始通過琴，汪淼舉著望遠鏡的手開始顫抖，直到船頭上的人通過琴后到底，整艘船通過琴的進度隨之加快，一切都被銷毀了。隨著船身完整通過后，船上已無一人生還，船上的伊文斯隨著審判日號一起被四分五裂，轟然倒塌。汪淼徹底松了口氣，心中懸著的那塊石頭也松了下來。指揮官與汪

葉文潔從不讓楊冬去見紹琳，楊冬似乎也早已明白了。葉文潔早已對人類文明失望，其實她并沒有和三體文明取得文明，而是另外有人和他們取得了聯(lián)系。進入大學半年后，葉文潔為一個課題進入基地選址，一直到了一個鄉(xiāng)村里，老鄉(xiāng)說這里有一個“白求恩”，不遠萬里來到中國就為了種樹。他就是伊文斯，老鄉(xiāng)不理解他在這里到底要干什么，伊文斯的回答是當救世主，但他拯救的方法卻并不是拯救全人類。而是種樹。他在這里種樹出名了，老鄉(xiāng)說縣里要給他獎勵，不過伊文斯顯然不屑一顧。葉文潔對伊文斯很感興趣，其實他是一個億萬富翁的兒子，他和葉文潔講述了一件十二年前的事情，是那件事徹底改變了他。父親為了石油殺了很多海鳥，在他看來所有人類包括父親都是劊子手，不過那個時候葉文潔能理解他。葉文潔也是第一次在伊文斯口中聽到物種品等這四個字，在他看來人類是實現(xiàn)他這一理想的原因。葉文潔雖然并不認同，卻也很羨慕他。后來葉文潔很快回到了北京，和伊文斯也很長時間沒有再見，但收到了伊文斯的明信片。于是葉文潔再次回到了那個偏僻的西北山村，父親去世了他繼承了他的所有財產，他認為父親或許很重視他，也很看重他的理想。在國外，伊文斯也得知了一個消息，他種的樹全部都被砍