結(jié)束大致的案件詢問(wèn)之后柯南一行人決定開(kāi)車送圭小姐回家，卻發(fā)現(xiàn)圭小姐家中被安裝大量的竊聽(tīng)器，在尋找竊聽(tīng)器的安裝地點(diǎn)時(shí)竟然找到了一具男尸。另一方面跟著打算買東西的圭小姐而離開(kāi)公寓的柯南被綁架，接到小蘭的電話后阿笠博士立即和灰原在昴先生的陪同下開(kāi)始追蹤，而了解了事情始末的世良也前去和小蘭會(huì)面。

來(lái)到熊本阿蘇火山旅行的柯南等人不幸卷入了事件，盜取熊紋食品機(jī)密資料的犯罪嫌疑人試圖取回贖金時(shí)被步美打斷，藏有機(jī)密隨身碟的熊本熊玩偶陰差陽(yáng)錯(cuò)到了小男孩賈斯丁手中，與賈斯丁有過(guò)一面之緣的柯南等人好不容易才找到了他的線索，但卻被犯人搶先了一步，現(xiàn)在丟失的不只是機(jī)密文件，連同賈斯丁也被綁架了。

以大阪發(fā)生的事件為契機(jī)，平次等人特地來(lái)到東京搜查，事件現(xiàn)場(chǎng)是一所公寓的房間，經(jīng)過(guò)柯南和平次的調(diào)查后判定這是一起自殺案件，利落解決案件的柯南等人準(zhǔn)備乘坐電梯回去時(shí)又發(fā)生了命案。乍看之下發(fā)生在眼前的是自殺案件，但柯南和平次發(fā)現(xiàn)了很多疑點(diǎn)，根據(jù)高木警官打聽(tīng)的結(jié)果，柯南等人鎖定了三名嫌疑人。

新印象公司旗下的業(yè)務(wù)員們發(fā)生不斷遭人襲擊重傷的案件，犯人甚至脅迫新印象公司的社長(zhǎng)要求支付現(xiàn)金，隨后犯人進(jìn)一步指明交付現(xiàn)金的必須是毛利小五郎，而警方還不知道犯人會(huì)以什么樣的方式接受現(xiàn)金。犯人利用電磁鐵取走現(xiàn)金的手法已被破解，而嫌疑人西澤也浮出水面，在小蘭和柯南前往西澤家調(diào)查時(shí)卻看到了他的尸體。

柯南已經(jīng)從對(duì)三位女性的拜訪中知道了真正的兇手，情奈小姐敷衍并粗糙的犯案手法讓柯南非常擔(dān)心她事后會(huì)做出傻事，但柯南推理中的疏忽讓兩人陷入了危機(jī)。持槍的劫犯挾持柯南和情奈駕車逃跑，知道了情況的眾人都緊跟其后，最終世良出手救下了柯南，在營(yíng)救過(guò)程中安室和昴撞了個(gè)照面，而兩人都露出了詫異的表情。