小五郎受到一個(gè)名叫立李三可的委托，帶著柯南和小蘭一起來到群馬縣調(diào)查真相，途中他們遇見了德備六朗和荒巖，并從他們口中得知了11年前有一個(gè)名叫辰彥的孩子在旅館附近的河中溺斃而亡的事件，這與信中所提及的殺人案有何聯(lián)系？辰彥父親同時(shí)也是約見地點(diǎn)光羅旅館的老板沼山伴藏也讓人覺得很怪異，次日清晨，滿身都是刺鼻氣味液體的伴藏死在了旅館的頂樓房間，難道是小蘭昨晚在河邊看到的河童下的毒手嗎？

在參加大學(xué)校慶的柯南和小蘭等人遇到了殺人事件，就在警官要判定為自殺事件的時(shí)候，在柯南的引導(dǎo)下警方判斷此次為他殺事件。而安菜在小蘭她們進(jìn)來之前已經(jīng)死亡，但此時(shí)如何讓桌子擺動(dòng)的事情成為了破案的關(guān)鍵，而表演時(shí)站在安菜周圍的三人成了重點(diǎn)懷疑對(duì)象。經(jīng)過對(duì)現(xiàn)場(chǎng)的調(diào)查柯南很快發(fā)現(xiàn)了犯人的犯罪手法和犯人的身份，在確鑿的證據(jù)面前犯人最終承認(rèn)了罪行，并說出了殺死安菜的理由。

小五郎應(yīng)“草莓雙人組”中藤森朝子之邀前來參加她的慶生會(huì)，沒想到開門的朝子小姐竟然一臉驚恐滿身是血的出現(xiàn)在小五郎面前，她說有人突然闖入屋內(nèi)向她發(fā)動(dòng)襲擊，進(jìn)屋后，柯南發(fā)現(xiàn)了一具頭戴僵尸面罩的的尸體，而這個(gè)人正是朝子小姐的搭檔今岡次郎，警方把這起案件初步斷定為正當(dāng)防衛(wèi)，但柯南卻察覺到這是一起蓄意謀殺案！

小五郎曾抓捕過的殺人犯富樫文孝，在假釋的第二天再次因?yàn)闅⑷吮蛔ミM(jìn)了警局，小五郎深信決定重現(xiàn)做人的他不會(huì)再做出這種殺人的事情，便在偵訊室里勸導(dǎo)他說出真相，可是富樫卻一直保持沉默。另一方面，柯南和高木警官再次來到案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)進(jìn)行調(diào)查，根據(jù)目擊者的證詞以及附近便利店的監(jiān)視影像，柯南發(fā)現(xiàn)事情的真相并非那么簡(jiǎn)單，因?yàn)榘赴l(fā)現(xiàn)場(chǎng)除了富樫還有另外一個(gè)人。

福爾摩斯啟示錄(0 is start)到了搶七局的關(guān)鍵時(shí)刻，米奈芭打出了關(guān)鍵的一球，通過最后一球的拉鋸戰(zhàn)柯南不斷觀察犯人的位置。拉鋸戰(zhàn)之后米奈芭失掉了最后一球就在這時(shí)她提出了異議，通過慢鏡頭的回放最終取得了這一局的勝利，而柯南也通過拉鋸戰(zhàn)找到了犯人所在的位置。在父母的幫助下柯南順利的進(jìn)入賽場(chǎng)。就在柯南要制止罪犯之時(shí)卻被人認(rèn)了出來，最終米奈芭和柯南聯(lián)手組織了罪犯。