一波未平一波又起，繼越路被人襲擊之后，彌山屋也意外失火，并且有目擊者表示彌山的哥哥曾出現(xiàn)在火災現(xiàn)場，案件越來越撲朔迷離，小五郎和警方等人決定先回廣島試圖從紳六的友人著手調(diào)查，沒想到悲劇再次發(fā)生，上諏訪被不明人士襲擊，這同樣與宮島的七大不可思議相關，柯南想到了上諏訪曾說的話，而這也正是破案的關鍵，沒想到兇手居然是擁有最有力不在場證明的那個人！

在參加大學校慶的柯南和小蘭等人遇到了殺人事件，就在警官要判定為自殺事件的時候，在柯南的引導下警方判斷此次為他殺事件。而安菜在小蘭她們進來之前已經(jīng)死亡，但此時如何讓桌子擺動的事情成為了破案的關鍵，而表演時站在安菜周圍的三人成了重點懷疑對象。經(jīng)過對現(xiàn)場的調(diào)查柯南很快發(fā)現(xiàn)了犯人的犯罪手法和犯人的身份，在確鑿的證據(jù)面前犯人最終承認了罪行，并說出了殺死安菜的理由。

解決了暗號事件回到日本的柯南終于恢復了正常的生活，在放學回家的路上元太提議大家進入即將拆遷的大樓內(nèi)來玩捉迷藏。就在這時元太發(fā)現(xiàn)有奇怪的敲打墻壁的聲音，柯南發(fā)現(xiàn)這是有人發(fā)出的求救聲音，就在他們在搜尋的過程中發(fā)現(xiàn)了在檢查大樓的兩個工人。兩人告訴柯南他們那是他們發(fā)出的響聲不用在意但在柯南的推理下少年偵探團們開始尋找被困的人，就在這時之前的檢查工人卻抓住了小哀，究竟應該這應該辦！

這天小五郎帶著柯南和小南外吃吃飯，回家的途中遇到故意向須坂和中北的汽車，柯南用自己的充氣足球阻止了再次撞向兩人的汽車。作為答謝片寄邀請小五郎一行來到家里，而小五郎他們在門口碰到了發(fā)生口角的野笛和荻人。柯南和中北一起在院子里玩耍時發(fā)現(xiàn)倒地身亡的片寄爺爺！而在調(diào)查過程中須坂拿出了老爺讓保管的鑰匙，而盒子里留下的卻是一封暗號信。

服部這次帶來的案件是五年前去世的犬伏集團會長的養(yǎng)子女們接二連三離奇死亡的事件，而且據(jù)說案件是由身上纏繞火焰像犬一樣的魔物所造成的，因為其中一名養(yǎng)子跟和葉的母親是舊識，于是柯南和服部一起登門拜訪探聽詳細情況，沒想到對方的名字竟然是工藤伸一與工藤新一讀音相似，在他們詢問之前，伸一竟然被人設計成一氧化碳中毒而亡，之后，前來調(diào)查的警方從死者口中發(fā)現(xiàn)了一顆掉落的珍珠，這會是死者留下的死亡訊息嗎？