柯南在新出醫(yī)院遇到的老先生說了一段讓人匪夷所思的鬼怪理論，為了探求真相，柯南等人來到了這棟有鬼出沒的公寓，在其旁邊還有一棟因人自殺而停工的公寓，正前方的公園也曾現(xiàn)過一具女性的焦尸，這些傳聞聽著就叫人毛骨悚然。當(dāng)晚，大家在老先生的房中等鬼出現(xiàn)時，卻不知不覺都睡著了，恍惚中，電視自己打開并出現(xiàn)了恐怖畫面，而馬桶的水也突然變成紅色，窗外還出現(xiàn)了鬼影，難道這棟公寓真的有鬼？如果這一切都是人為，那么他又有什么目的呢？？

平次和合葉被惡毒的律師美里沙關(guān)了起來，并強(qiáng)迫服部來解開楠川偵探留下的一句暗號。另一方面柯南雖然在掌握了平次他們的行蹤，但因為找不到只好找了家飯店吃午飯。突然平次打了一通電話過來，要求幫忙解暗號密碼，但柯南發(fā)現(xiàn)了暗號密碼的異常。此時，服部也為美里沙解開了暗號的謎題，而柯南也成功解除謎題并報警解救出平次和葉子。

高木警官和佐藤警官瞞著警局里的同事們，偷偷在熱帶樂園的水世界見面，為了阻撓他們的約會，警局的同事們暗中搗鬼，安排柯南，光彥等人出現(xiàn)在他們面前，就在這個時候，高木警官原本裝有求婚戒指的包居然出現(xiàn)毒品，之后，他意識到這一定是在搭乘“海地五萬里列車”時被人調(diào)了包，柯南根據(jù)這個包包的肩帶判斷出他的主人是個左撇子，并根據(jù)當(dāng)時所拍攝的照片和游客所填寫的信息表，將目標(biāo)鎖定在一個叫高城登的人身上。

白鳥警官的車突然發(fā)生爆炸，所幸他并沒有當(dāng)場死亡而是被立馬送去了醫(yī)院，在他的手中，佐藤警官還發(fā)現(xiàn)一封和三年前相似風(fēng)格的挑戰(zhàn)書，為了尋找炸彈，警察在慌亂中展開調(diào)查，柯南也從佐藤警官那里得知了，這個爆炸狂與警察的淵源，七年前警察和兩名歹徒產(chǎn)生了誤會，而導(dǎo)致其中一人出車禍死亡，于是這名活下來的歹徒便安放炸彈報復(fù)警察。

柯南和小蘭準(zhǔn)備食材的時候遇到了舊識西村佐知子，她也正在為自己男朋友的到來而滿心期待的做準(zhǔn)備，只是沒想到第二天，佐知子居然被人用銅質(zhì)裝飾品擊中后腦勺而喪命，警方認(rèn)為她男朋友殺人的可能性最大，但小蘭卻無論如何都不愿相信這是事實，于是，她在柯南的暗中提醒下展開了調(diào)查，在詢問了佐知子同事之后，小蘭得知了一個驚人的秘密！