雖然沒找到什么關(guān)鍵線索，但小五郎他們卻從當(dāng)?shù)厝丝谥械弥怂懒_神的傳說，難道這一切都是死羅神的懲罰？次日一大早，新一就獨自前往日源村長家，當(dāng)服部趕到時，竟然看到新一滿身是血的站在記者河內(nèi)深里旁邊，他深信兇手一定不是新一，于是在警察趕到前將他藏到了后車廂，并且還特意交代讓小蘭、和葉等人暫時瞞過警察，可小蘭卻突然跑進(jìn)了森林……

小蘭從昏迷中醒來時發(fā)現(xiàn)自己在一個小木屋里，并且身上的傷也被人包扎好了，這時，小五郎他們也找到了這里，服部在隔壁的房間發(fā)現(xiàn)了很多新線索，他把案件從新理順后，將所有人都叫到了村長家，并指認(rèn)這個用刀刺傷河內(nèi)深里的人就是他身旁的工藤新一，沒想到被揭穿后，新一竟然嚎啕大哭并主動承認(rèn)自己的罪行，就在這時，死羅神出現(xiàn)。

竹內(nèi)先生因為肇事逃逸而被檢察官拘留，可妃英理認(rèn)為竹內(nèi)既然是自首并主動承認(rèn)罪行應(yīng)該有被保釋的權(quán)利，之后，柯南和小五郎經(jīng)過調(diào)查發(fā)現(xiàn)撞人的可能是竹內(nèi)的妻子，于是，妃英理以此為籌碼再次要求放人，可沒想到的是竹內(nèi)才被保釋出獄，他就在自家陽臺跳樓自殺，而目擊證人正是九條檢察官，為探尋真相，柯南和小五郎重返案發(fā)現(xiàn)場……

警察分別對嫌疑人詠子、菊代和瀨川進(jìn)行了偵訊，可是每個人都有不在場的證明，這時，英祐突然發(fā)現(xiàn)自己與母親的合照不見了，于是柯南，小蘭陪他一起去泳池那邊尋找，看著鍛吾的死亡地點，柯南腦中重現(xiàn)當(dāng)時的情景，他將所有的線索連成一線，真相浮出水面，隨后，他用老方法讓小五郎沉睡，并指揮高木重現(xiàn)兇手所使用的手法，沒錯能這么做的只有那個人！

當(dāng)晚，這名潛入醫(yī)院的黑暗組織同伙南田陸道果然展開了行動，但同時FBI也暴露了行動，南田陸道在驅(qū)車逃跑的過程中舉槍自盡，雖然柯南破壞了他的手機(jī)但他還是通過其他手段將搜集來的信息傳給了組織。既然事情發(fā)展到這種地步，轉(zhuǎn)院無疑就是在向黑暗組織昭示水無憐奈就在這里，所以只能另想對策。另一方面，英祐伺機(jī)潛入了水無憐奈的病房，并發(fā)現(xiàn)她早已從昏迷中蘇醒。