少年偵探團(tuán)在超市里玩從收銀條上的物品名稱猜晚飯的菜名的游戲。其中發(fā)現(xiàn)了可疑的收銀條，柯南她們開(kāi)始尋找買這些東西的人，想要阻止他。通過(guò)分頭尋找自行車燈少年偵探團(tuán)的成員們最終找到了犯人，但中途卻失去了犯人的行蹤。在元太無(wú)意的提醒下，柯南他們抓到犯人現(xiàn)行。最終柯南用腳力增強(qiáng)鞋制服了犯人。

死者是奈緒子，柯南和服部在案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)發(fā)現(xiàn)了魚鱗和腳印，然而腳印的方向卻通向大海，只靠這些零星的線索，根本無(wú)法抓到兇手。這時(shí)，君惠說(shuō)她有今年祭典購(gòu)買號(hào)碼牌的名冊(cè)，于是柯南一行人前往神社，悲劇再次發(fā)生，君惠為找名冊(cè)死在倉(cāng)庫(kù)的大火之中。之后，柯南和服部分頭行動(dòng)，服部發(fā)現(xiàn)了新的線索，正巧此時(shí)柯南打來(lái)電話，他到底推理出了怎樣的真相而讓服部吃驚不已？上山找門脅時(shí)，和葉為救服部墜落懸崖，她能否化險(xiǎn)為夷？

柯南，小蘭與小五郎秋季去松江旅行時(shí)結(jié)識(shí)了大阪來(lái)的和歌團(tuán)的5名成員。5人分別是文學(xué)家，牙醫(yī)，和果子店主，圖書管職員，投資家。這是一個(gè)連句愛(ài)好者的聚會(huì)。連句愛(ài)好者的各位因?yàn)槌楹灈Q定了每人所要吟詠的地方而分頭行動(dòng)。第二天，投資家被殺害的尸體在松江城發(fā)現(xiàn)，而剩下的成員全對(duì)投資家心懷恨意。

霧之峰賓館的主人寺院晚上開(kāi)車出去兜風(fēng)，第二天在停車場(chǎng)發(fā)現(xiàn)坐在車子里的寺院已經(jīng)死了。在調(diào)查的過(guò)程中發(fā)現(xiàn)每個(gè)人和寺院似乎都有過(guò)節(jié)。柯南發(fā)現(xiàn)車罩上裂痕的疑點(diǎn)，而停車場(chǎng)看守的證詞又增加了疑團(tuán)。最終柯南發(fā)現(xiàn)了犯人的犯罪手法并當(dāng)場(chǎng)演示給眾人，而殘留的焦油也暴露了兇手的身份。

茂木認(rèn)為小五郎是兇手而開(kāi)槍將他射傷，當(dāng)前來(lái)“黃昏別館”的所有名偵探都命喪黃泉時(shí)，電腦上居然出現(xiàn)了一行關(guān)于寶藏的信息，一直躲在監(jiān)視器操控室的神秘幕后黑手終于按捺不住露出了真面目，沒(méi)想到這個(gè)人居然是……柯南引導(dǎo)她說(shuō)出了整件事的真相，而這時(shí)，本應(yīng)死去的偵探們居然都出現(xiàn)在門口，可到底是怎么回事？這棟別墅的寶藏又是什么？