妃英理律師與號稱美女檢察官的九條對簿公堂，本案的被告入室盜竊被屋主發(fā)現(xiàn)，當(dāng)他們扭打的時候，被告人不慎失手將屋主殺死，但九條卻認(rèn)為被告是蓄意謀殺，甚至想以強盜殺人的罪名讓被告入罪，面對咄咄逼人的檢察官，妃英理勢必會陷入一場硬戰(zhàn)。為幫助妃英理，柯南和小五郎前往案發(fā)現(xiàn)場重新調(diào)查，他們竟然在這里發(fā)現(xiàn)了一條關(guān)鍵線索。

追蹤光彥而來到群馬縣山中的柯南他們，得知一名連續(xù)殺人犯逃入了同一森林中。沿著小河走的光彥與推理中的柯南用偵探徽章呼叫他時，光彥被殺人犯逮著。哀告訴柯南沼淵原來是組織的成員。柯南正要告訴哀光彥來此的目的時，光彥的徽章聲音迫近了。終于在眾人找到光彥的時候驚訝的發(fā)現(xiàn)他和光彥在一起！原來兩人都只是為了來看螢火蟲。

柯南他們少年偵探團(tuán)坐阿笠博士的車去野營。在那里認(rèn)識了4個戶外同好會的大學(xué)生。晚上他們中間的泰美卻不見了。柯南他們?yōu)榱藢ふ姨┟蓝鴣淼椒艧熁ǖ母吲_，但在途中撞飛了落下的欄桿。到達(dá)高臺后仍然不見泰美的蹤影，在回來的路上，卻發(fā)現(xiàn)了倒在路邊的泰美遺體出現(xiàn)在街上。雖然看似事故的現(xiàn)場但在高木警官的提醒下警方最終確定是他殺事件！

如果電話一直沒人接，黑暗組織必將有所行動，于是柯南拿起電話利用變聲領(lǐng)結(jié)和沃克商量交易的時間和地點，將交易時間提前之后，阿笠博士和柯南立刻開車返回東京，不料車子居然爆胎，就在這時，路上駛來一輛車，搭上順車的柯南發(fā)現(xiàn)車?yán)锏囊荒幸慌苁枪殴?，疑似新聞里所說的珠寶大盜，途中，他們還遇到了群馬縣警察臨時檢查，不過柯南并沒有揭穿他們，難道柯南就這樣讓他們逃脫警方的追捕逍遙法外？

少年偵探隊在調(diào)查連續(xù)闖空門事件的時候，一幢公寓里突然傳出女聲尖叫，原來這名叫細(xì)野的小姐在買回來的二手沙發(fā)里發(fā)現(xiàn)了一具女尸，警方懷疑是她就是兇手，但細(xì)野卻有不在場的證明，這時，她的鄰居德永先生剛好回來，他說昨天聽到細(xì)野房中有爭執(zhí)的聲音，為搜集更多線索，高木去了那家二手家具店調(diào)查，得知那個沙發(fā)其實是從細(xì)野家附近的垃圾堆撿到的，一切又回到原點，就在大家一籌莫展時，光彥說他知道誰是兇手……