小五郎帶柯南和小蘭去菜園屋頂?shù)臅r(shí)候，發(fā)現(xiàn)了其中一塊菜田主人中村的尸體，表面上看像是因?yàn)槟_底打滑磕到了后腦勺的意外死亡，但柯南察覺(jué)到了其中的蹊蹺，警察找來(lái)屋頂菜園的其他三名種植者進(jìn)行偵訊，每個(gè)人都沒(méi)有不在場(chǎng)的證明，并且其中一人的供詞卻引起了柯南的注意，當(dāng)大伙兒再次來(lái)到菜園進(jìn)行現(xiàn)場(chǎng)調(diào)查時(shí)，柯南發(fā)現(xiàn)了一塊奇怪的磚頭，而這無(wú)疑是找出兇手的關(guān)鍵線索。

阿笠博士帶少年偵探團(tuán)來(lái)到一家位于箱根的溫泉旅館，那里正好在進(jìn)行《血殷殺手》系列最新作品的拍攝，因此，大家結(jié)識(shí)了劇作家鐵山巖治、女主角名取深汐、經(jīng)紀(jì)人丹沢純作以及男主角寺堂云平。次日，元太他們一起去湖上露天溫泉的時(shí)候，卻在女湯發(fā)現(xiàn)了鐵山巖治的尸體，從現(xiàn)場(chǎng)來(lái)看兇手應(yīng)該是在發(fā)案之后趁機(jī)混入了騷動(dòng)之中，調(diào)查之后，警方將嫌疑鎖定在深汐、丹沢、寺堂三人中。

就在所有人驚訝于晶子之死時(shí)，樸之木匆忙跑來(lái)說(shuō)漫畫(huà)家比良坂也死在了房間中，于是，小五郎、柯南等人急忙趕到現(xiàn)場(chǎng)，這又是一起密室殺人，詭異的是這個(gè)房間的門口堆滿了被撕碎的小煌小姐的海報(bào)碎片，警方展開(kāi)調(diào)查并對(duì)別墅里的所有人進(jìn)行偵訊，八川談到了澤南被殺的命案，以及比良坂、澤南和樸之木受到不明人士威脅的事情，難道這與此次的密室殺人案有關(guān)系？澤南死前所留下的死亡訊息又隱藏著什么意義？

就在兇手企圖用球棒襲擊被騙到音樂(lè)室的小林老師時(shí)，他卻反過(guò)來(lái)被小林老師撂倒，這時(shí)，少年偵探團(tuán)和白鳥(niǎo)警官出現(xiàn)，原來(lái)小林老師早已被白鳥(niǎo)警官所保護(hù)而眼前這個(gè)人正是佐藤警官，期間，小林老師想起了以前在書(shū)店發(fā)生的事情，誤會(huì)消除的二人重歸于好。麒麟角是鈴木次郎吉在山中寺廟發(fā)現(xiàn)的寶物，而基德又以此為目標(biāo)出了預(yù)告函，次郎吉率領(lǐng)基德無(wú)法喬裝的少年偵探團(tuán)以及進(jìn)行直播的工作人員來(lái)到寺廟，麒麟像被藏在寺廟的立柱中間，想要拿取它并非易事……

大家二次來(lái)到倉(cāng)庫(kù)后發(fā)現(xiàn)了在門上方供奉著的神壇，而讓柯南更為好奇的是神壇對(duì)面的大算盤，這很可能是啟動(dòng)機(jī)關(guān)的鑰匙，仔細(xì)觀察倉(cāng)庫(kù)之后，柯南發(fā)現(xiàn)了其中的蹊蹺，他叫來(lái)警察與他一起根據(jù)灰塵的多少撥動(dòng)算珠，果不其然，天花板漸漸向下移動(dòng)，警察不僅在這里找到了被盜的寶物還抓住了偷盜者，案件結(jié)束后，柯南揪出了那個(gè)一直暗中幫助元太他們的“軍師”，而這個(gè)人正是……