小五郎的朋友向日葵酒吧的老板井上弘子意外被人殺害，當(dāng)他和柯南趕到案發(fā)現(xiàn)場時，弘子的男朋友高岡明已守在尸體旁邊，目暮警官等也展開了調(diào)查，據(jù)周圍人所說，在案發(fā)期間并沒有人出入死者所在的公寓，并且嫌疑人高岡明當(dāng)時也有充分的不在場證明，就在警方斷定這是起入室搶劫殺人事件時，柯南發(fā)現(xiàn)了關(guān)鍵線索，他重新推斷死亡時間，并斷言這里并非案發(fā)的第一現(xiàn)場。

少年偵探團在米花公園附近遇到了步美以前的鄰居秋本小姐，她正準(zhǔn)備去附近的警局找每晚都能遇到了大胡子警察道謝，沒想到詢問后卻發(fā)現(xiàn)根本沒有這個人，碰巧這附近頻頻發(fā)生闖空門事件，大家懷疑那個假警察就是盜竊犯，于是柯南他們分頭展開調(diào)查，意外的是大家都對這個冒牌警察贊不絕口，他到底是誰？又是為了什么目的而假扮警察？

簡單問過案情之后，小五郎隨警方來到案發(fā)的二樓進(jìn)行查看，根據(jù)死者頭部的槍傷，推斷出兇手的身高應(yīng)該在在180cm左右，雖然船本先生有嫌疑但卻低于死者，種種推斷都否決了船本殺人的可能，然而，柯南卻在他輪椅上發(fā)現(xiàn)了蔥，沒錯，兇手就是他，可是他到底是如何犯案？消失的珍珠項鏈又被如何處理了？

在去往餐館的路上，柯南和小五郎目睹了一起車禍，所幸受害者立松新三郎和小此木清隆都沒有生命危險，本以為這是場單純的車禍，但有目擊者表示那輛肇事車并非偶然經(jīng)過，如此看來這是一起殺人未遂案件。隨后警察找來了小此木的外甥和她未婚妻一倉分別進(jìn)行了偵訊卻并未發(fā)現(xiàn)異常，這時，“日本第一倒霉的男人”立松說歹徒的目的是置他于死地，事情的真相果真如立松所說嗎？

茱蒂老師以卡梅隆搜查官女朋友的身份出現(xiàn)瞞過了木暮警官，這時，警方找到了一個裝有雨衣和兇器的紙袋并且還在死者的便簽本上發(fā)現(xiàn)了一句疑似死亡訊息的話，根據(jù)這些線索，就連第一個發(fā)現(xiàn)尸體的女秘書也成了懷疑的對象。另一方面，水無憐奈雖然重新回到黑暗組織，卻遭到組織的懷疑，為了證實她是否被FBI所籠絡(luò)，組織派給她一件任務(wù)，那就是殺掉赤井秀一。