根據(jù)圖畫書中的線索，柯南等人得知還有其他炸彈存在。目暮警官馬上出動全體警力前去搜查，不料卻發(fā)現(xiàn)其余的炸彈都只是爆炸犯捉弄警方的惡作劇，而真正的炸彈早已按照計劃在指定地點爆炸。正當(dāng)調(diào)查一籌莫展時，目暮警官突然接到匿名電話報警，稱自己發(fā)現(xiàn)了爆炸犯的藏身之處。而正當(dāng)眾人趕往此地時，據(jù)稱是犯人居住的地方卻再一次發(fā)生了爆炸……

毛利小五郎撿到一張中了大獎的賽馬彩票，便帶著柯南和小蘭一起去壽司店慶祝。壽司店內(nèi)新來的廚師很喜歡推理，與毛利小五郎交談甚歡，期間有三名客人陸續(xù)來到壽司店用餐。就在大家酒足飯飽準(zhǔn)備離開時，突然有一名客人沖進店內(nèi)，聲稱店里有人偷了自己的手包。隨后這名客人在壽司店的洗手間內(nèi)找到了遺失的手包，經(jīng)過一番檢查后，她告訴眾人自己丟了一張中獎的賽馬彩票。

警方確定了一起寶石搶劫案的嫌疑人，嫌疑人鷹取嚴(yán)男躲在一個倉庫里，不知為何柯南與小五郎也在場。警方突破倉庫門進入準(zhǔn)備抓捕嫌疑人時，鷹取嚴(yán)男打開事先設(shè)下的陷阱，趁現(xiàn)場混亂之時綁架了柯南當(dāng)做人質(zhì)逃跑。柯南在犯人車上伺機逃跑，不料卻跑進死胡同里被抓。無奈之下柯南被帶到了一個荒廢的倉庫里，犯人鷹取嚴(yán)男究竟想讓柯南做些什么？

柯南和平次傳來歷史學(xué)家的死訊，眾人陷入恐慌，并認(rèn)為是怪物鵺在作怪。平次吩咐大家各自回房不要出門，考古學(xué)家主動要求與小蘭交換房間。眾人回房后，柯南與平次在院子里和村長詢問細(xì)節(jié)，院子卻突然再次著火，與此同時樓上的考古學(xué)家似被不明物體擊中，慘叫一聲后倒在房內(nèi)，待柯南等人趕到時已經(jīng)喪命。經(jīng)過一番調(diào)查和推理，柯南和平次似乎有些眉目，而那只被大家遺忘在家中的狗突然引起了二人的注意。

通過與世良的接觸，柯南回憶起與世良初次相遇的情形。十年前，秀一從美國回到日本，與家人一起在海灘游玩，恰好偶遇了年幼的新一和小蘭。沉迷偵探游戲的新一引起了秀一的興趣，正當(dāng)二人交談甚歡時，突然有一輛車從沿海公路上沖破護欄墜入深海。秀一馬上潛入海中實施救援，卻發(fā)現(xiàn)駕駛員已當(dāng)場死亡。根據(jù)秀一的推斷，案發(fā)前車上應(yīng)該還有死者的同伴，而死者的身份也是疑點重重……