異常點開啟在醫院里，這回光顧的是二疊紀的雙齒獸，它們活潑可愛，就是愛惹些小麻煩。再加上趕上孕婦梅勒妮生產，簡直搞得卡特等人焦頭爛額。當一切處理妥善，卡特等人回到異常點研究中心時，卻發現那里已被海倫和她的復制品手下們所控制。海倫逼迫卡特說出一個不明物品的用處，卻遭到了拒絕，于是惱羞成怒的海倫命令手下引爆炸彈。幸運地被救出火海的卡特，卻重新沖回火海尋找一個重要的盒子，不想卻慘遭海倫的毒手。彌留之際，卡特將不明物品交給康納，并囑咐康納代替自己繼續異常點的研究。

"中出現的高智慧未來生物！Lester平日里一副不經事的模樣，此時此刻卻表現得異常英勇。最終，在猛犸象的“幫助”下，兩個未來生物都被殺死了。 趕回來的Cutter與Connor等人開始破譯Leek的個人檔案，但是他們萬萬沒有想到——他們又中了Leek的詭計，一個定時炸彈被啟動了，異常點研究中心危在旦夕！不過，聰明的Cutter在最后關頭阻止了炸彈的爆炸。隨后，Cutter發現那些未來生物被安裝了遙控控制器，于是叫Connor用異常點探測器檢查遙控信號的源頭。Lester堅持要求軍方控制局面，禁止 Cutter等人參與行動。但是Connor用異常點探測器找到了Caroline的手機信號，于是決定和Abby一同去尋找被“綁架”的Rex。閑得無聊的Cutter也跟了過去，順便拉上了無事可做的Jenny。 當眾人跟蹤Caroline的手機信號來到一個廢棄倉庫時，等待他們的卻不是Caroline，而是Leek和他荷槍實彈的雇傭兵！還有Helen！還有……第二季中出現過的所有遠古（未來）生物！ 一只兇猛的怪獸大軍已然形成，世界將陷入一片混亂。在這個關鍵時刻，有一個人挺身而出，成了最關鍵的人物……究

Connor對自己的朋友講起自己遇到的遠古動物，朋友們卻把他當作笑談，并沒在意。大家在迪恩森林發現的異常點已經消失，Connor在網絡上發現了一些線索，可能是另一個可以進入遠古時代的異常點。Connor找到Abby將自己的發現告知了她，并與她成為伙伴共同去尋找。在繁華城市的地鐵里又出現了一種屬于遠古的兇猛生物，導致一名工作人員遇害。Cutter一直對妻子的失蹤感到耿耿于懷，認為自己要負很大的責任。在尋找另一個異常點的路上Connor和Abby二人被阻止，被迫返回。為了找到地鐵里的未知生物，政府關閉了地鐵隧道，并且派出特種部隊前往，部隊發現無數可以噴出毒液型似蜘蛛的奇怪動物，并受到嚴重攻擊，傷亡慘重，Cutter分析這些可能是更古老的時代的生物入侵，Cutter三人為了查明真相深入險境，終于發現原來地鐵隧道一個偏僻的角落里藏著又一個可以通向遠古的異常點。在三人正要離開之時，遭到一種更加兇猛的類似蜈蚣的遠古生物襲擊，Cutter與伙伴們分開，獨自一人被困在隧道中，到處充滿著危險。Stephen為了救出Cutter孤身一人深入隧道，卻遭到更大的危險，朦朧中Stephen跟Cutter一樣似乎

Stephen聽信Helen的話，與Cutter產生了矛盾；Cutter、Jenny、Connor和Abby四人為尋找Caroline，落入了 Leek精心設下的圈套；Lester被Leek玩弄于股掌之間，卻無計可施－－異常點研究中心的所有人都遇到了前所未有的巨大挑戰。 Cutter在監獄中醒過來，和他被關在一起的Jenny表達了心中的不安，并隱隱透露出自己對Cutter的感受。Cutter知道監獄中安放了竊聽器，于是故意告訴Jenny，自己可能還愛著Helen。一直偷聽兩人的談話的Helen聞言，心中不禁為之一動。另一間囚室里，Leek帶著渾然不知真相的Caroline來見Abby等人。Abby為Lex的事遷怒于Caroline，Caroline不肯相讓，兩個女孩大打出手。 某個海濱度假勝地，Leek派出的人偷偷釋放了一只志留紀的沙地蝎子，熱鬧的沙灘立即變成了血腥的屠場。Lester接到報告后，又找不到Cutter等人，急得如同熱鍋上的螞蟻，只好求助于對他心存芥蒂的Stephen。Stephen擔心公眾的安全，勉為其難地接下了任務。與此同時，Helen向Cutter若是若非地透露了自

政府派人從異常點進入遠古時代抓回了Cutter的妻子Helen，官員想通過她對異常點的了解提供線索，但Helen不肯。最后要求見丈夫Cutter，此時Helen似乎突然感應到什么，提醒如果還不采取行動將會有成群的遠古猛獸出現在倫敦街頭，Cutter被Helen的言語驚得目瞪口呆。立刻將此事報告政府官員，大家在吃驚的同時，派了大批特種部隊前往阻止。在找到一個異常點時， Helen趁大家不注意時，突然沖入異常點，消失在眾人視野中。后來大家發現這個異常點后面是一個很大的異常點聚集地，Helen也早已失去蹤影。此時異常點里跑出了一群遠古動物度度鳥，一直跟蹤他們的兩個同學發現Connor所言是真的，并偷偷抓走了一只度度鳥回家。經過化驗，度度鳥體內藏有一種可以致人死亡的寄生蟲，兩個偷走度度鳥的同學之一Tom不小心被咬傷，寄生蟲進入了其身體，Cutter等人得知后立刻趕到，但已不見Tom蹤影。在醫院已經有一名醫生被Tom體內的寄生蟲侵入身體，為了防止寄生蟲繼續在人們中擴散，等人立刻采取行動，Tom抓走了Abby，經過眾人努力，最終在Connor的勸說下，Tom接受了事實，安然地死去。