簱本家族的人聚在餐廳斷定兇手就是小武 ，就在長女麻理子擔(dān)心去廁所遲遲未歸的兒子一郎時，游輪突然停電，隨之而來的是一郎的慘叫，在黑暗中他被兇手刺傷了腿，小五郎在電源室發(fā)現(xiàn)這是有人蓄意的斷電，他立刻命所有人留在餐廳，自己和柯南，小蘭尋找線索，迷霧漸漸撥開，兇手真的是突然消失的小武嗎？

清潔公司的董事藤井被樓上掉下的重物砸死，警察在尸體旁邊發(fā)現(xiàn)了一個沒有指紋的口風(fēng)琴，柯南認(rèn)為這并不是簡單的意外事件而是謀殺，警察去清潔公司社長中山的辦公室進(jìn)行調(diào)查時，這里的監(jiān)視器引起了柯南的興趣，在對監(jiān)視器進(jìn)行了簡單的操作后和攝影內(nèi)容簡單回查后，兇手浮出水面。

這天小五郎把打同樣喜歡麻將的肥田叫出來打麻將，可左等右等肥田都沒出現(xiàn)，于是決定到肥田的金融公司去看個究竟。當(dāng)他們到達(dá)肥田的住所時卻發(fā)現(xiàn)肥田已經(jīng)死亡！在詢問死者習(xí)慣的時得知肥田有把錢弄成扇形并舔手指數(shù)錢的習(xí)慣，而小五郎根據(jù)這個判斷兇手就是飯野。但在勘察現(xiàn)場之后柯南推理出犯人并不是飯野而是另有其人。最終在鐵證面前兇手承認(rèn)了自己的罪行。

柯南在朋友們?nèi)D書館做讀書報告時，警察突然來詢問圖書館職員玉田失蹤一事，館長津川表示自己也不清楚，警察做了簡單的搜尋后離開。但少年偵探團(tuán)留到夜晚做深入調(diào)查，期間館長曾鬼鬼祟祟的來過一次，等他離開后，大家發(fā)現(xiàn)館長在利用圖書館進(jìn)行販毒交易，當(dāng)他們找到被館長殺害的玉田的尸體時，沒想到館長也發(fā)現(xiàn)了他們，少年偵探團(tuán)能否順利脫險？

阿笠博士帶少年偵探團(tuán)來到野外，并交給他們一張地圖讓他們?nèi)ふ覍毑?，路上困難重重，但大家不畏艱險互相扶持，終于接近終點(diǎn)，柯南解開天之水與天之石的暗語，順利找到了藏有寶物的底下通道，這里有兩大袋珠寶，然而在途中碰到過的兩個行跡可疑的男人突然出現(xiàn)，柯南采用智斗將他們打到后，又發(fā)現(xiàn)了一個大木箱，這才是阿笠博士想讓他們找到的寶藏。