小五郎帶柯南和小蘭去露天浴場泡溫泉的時候，聽到了咔嚓咔嚓的石頭滑落聲，當(dāng)他們尋聲趕到后，發(fā)現(xiàn)不動產(chǎn)社長梅津英章已經(jīng)沒了呼吸，這起看似意外的事件其實是樁蓄意殺人案，警察對在場的嫌疑人即死者的女兒麻麗、泰子、秘書八木橋以及浴場老板進(jìn)行偵訊，期間，一條擰干的毛巾從麻麗的包包中掉了出來，小五郎認(rèn)為這是她為了不留指紋而使用手法，就在他準(zhǔn)備揭穿所謂的兇手時，知道真相的柯南將他麻醉揪出了真正的兇手！

這兩人竟然是長野縣警官上原由衣和大和敢助，他們此次前來的目的是讓柯南和小五郎幫忙破解沾滿鮮血的赤壁之謎！于是一行人來到案發(fā)的希望之館，這里曾經(jīng)住著六個很有才華的年輕人，自從三年前一名女性小葵心臟病發(fā)去世之后，她的丈夫明石周作就獨自一人留在館內(nèi)生活，可是他卻被人鎖在館內(nèi)的屋中活活餓死，如今能看到的只有他留下的奇特死亡訊息，這時，大和警官的死對頭諸伏高明警官也來到館內(nèi)進(jìn)行調(diào)查。

為了讓扭傷腳的柯南療養(yǎng)腳傷，大伙兒一起來到城崎溫泉，然而，小蘭卻突然失蹤，柯南從光彥他們所拍的照片上看到小蘭和一個小女孩在一起，同時照片上還出現(xiàn)了一個行蹤可疑的男人。這時，柯南他們遇到了服部，他受人委托前來找一個叫陽菜的女孩，而她正是和小蘭在一起的那個孩子。據(jù)陽菜的父親周平所說，在陽菜失蹤的同時他美術(shù)館里的展品彩虹之子也不翼而飛。就在大家四處進(jìn)行尋找時，陽菜和小蘭遇到了危險。

在參加大學(xué)校慶的柯南和小蘭等人遇到了殺人事件，就在警官要判定為自殺事件的時候，在柯南的引導(dǎo)下警方判斷此次為他殺事件。而安菜在小蘭她們進(jìn)來之前已經(jīng)死亡，但此時如何讓桌子擺動的事情成為了破案的關(guān)鍵，而表演時站在安菜周圍的三人成了重點懷疑對象。經(jīng)過對現(xiàn)場的調(diào)查柯南很快發(fā)現(xiàn)了犯人的犯罪手法和犯人的身份，在確鑿的證據(jù)面前犯人最終承認(rèn)了罪行，并說出了殺死安菜的理由。

迷路的小五郎、柯南和小蘭來到了一棟怪異的房子，在這里他們結(jié)識了雅原煌的影迷，為召喚一年前死于意外事故的偶像，這些人正準(zhǔn)備舉辦降靈會，因為影迷俱樂部之間流傳著小煌小姐詛咒的傳聞甚至還發(fā)生了殺人事件，于是，大家企圖通過降靈會來探究其原因。雖然降靈會期間發(fā)生的怪異現(xiàn)象都是作假的騙局，但是柯南卻發(fā)現(xiàn)小煌小姐之死似乎另有隱情，當(dāng)晚深夜，在舉辦降靈會的冥想之室，參加者之一的歌倉晶子被殺害。