小五郎帶柯南和小蘭去菜園屋頂的時候，發現了其中一塊菜田主人中村的尸體，表面上看像是因為腳底打滑磕到了后腦勺的意外死亡，但柯南察覺到了其中的蹊蹺，警察找來屋頂菜園的其他三名種植者進行偵訊，每個人都沒有不在場的證明，并且其中一人的供詞卻引起了柯南的注意，當大伙兒再次來到菜園進行現場調查時，柯南發現了一塊奇怪的磚頭，而這無疑是找出兇手的關鍵線索。

游戲公司社長的恩田和美遭到兇手槍擊身亡，小流氓大嶺良介涉嫌重大因此被通緝，他在購物中心劫持一名少女作為人質正打算逃跑時，被柯南發現，他成功救出了女孩但自己卻成為了新人質，大嶺驅車擺脫了警方的追擊，帶柯南來到一處地下室躲藏，期間，柯南試圖逃跑卻遭到不明人士的槍襲，所幸大嶺出手相救，柯南開始懷疑這個為自己負傷的人是否真的是殺人犯，或許這起殺人案的背后還隱藏著不可告人的內幕！

小五郎，柯南和小蘭三人在前往泡溫泉的路上遇到了一起交通意外，其中駕駛紅色車子的速水當場死亡，另一位車主車谷整司則身受重傷，據當地交警說發生車禍的原因可能是因為沖撞路線現象，但柯南卻并不認為這是單純的交通事故，因為他之前曾在便利店見過這兩輛車子，當時明明是開往不同的方向為什么會如此巧合的發生相撞，調查之后，事情果然如他料想一般，這是一起有預謀的殺人案。

來到野營地拍攝宣傳片的話題演員宮坂被殺害，而兇手就在野營地之中。而與宮本有正面沖突的山本，沖田和冴子嫌疑重大。就在柯南去勘察犯罪現場之時，美妃看到鷹山從窗邊逃走，就在眾人追尋鷹人來到懸崖之時發現鷹人已經墜崖身亡！而就在看了沖田的錄像后柯南發現了兇手的犯罪手法，犯人最終也承認了自己的罪行。

傳說中駕駛白色FD橫掃冬名山的銀白魔女，引起了小五郎調查的興趣，于是，他帶著柯南和小蘭向冬名山進發，濃霧彌漫的山中魔女的FD果然出現了，小五郎拼命追趕，而魔女卻消失在沒有路的云霧之中，他立刻與正在盤查的山村警官聯系并攔下了所有的白色FD，有三組車手接受了盤查，銀白魔女是否就在他們之中？