柯南等人幫助舊書店店主裕次郎搬運書籍，并在書店遇到了裕次郎的兒子一郎。一郎對于父親經營舊書店的事感到很不滿，爭執中眾人不歡而散。在光彥的帶領下，柯南等人來到了舊書店旁的公園，準備觀看蒸汽機車發動的場面，并在等待的途中偶遇了一郎。正當眾人與蒸汽機車合影完畢返回書店時，卻發現裕次郎被壓在了倒塌的書架下面……

柯南和平次傳來歷史學家的死訊，眾人陷入恐慌，并認為是怪物鵺在作怪。平次吩咐大家各自回房不要出門，考古學家主動要求與小蘭交換房間。眾人回房后，柯南與平次在院子里和村長詢問細節，院子卻突然再次著火，與此同時樓上的考古學家似被不明物體擊中，慘叫一聲后倒在房內，待柯南等人趕到時已經喪命。經過一番調查和推理，柯南和平次似乎有些眉目，而那只被大家遺忘在家中的狗突然引起了二人的注意。

7年前杯戶街上發生了一起搶劫殺人案，案件當時只有一個目擊證人，那就是5歲的小女孩友里未央奈。7年后小五郎帶著蘭和柯南一起來到鳩笛莊度假，友里未央奈正是鳩笛莊女主人的女兒。來度假的客人井出正也無意間談起了7年前很熱門的特攝劇彗星假面超人比恩，這讓友里未央奈陷入了恐慌之中，因為當年那起搶劫殺人案的犯人戴的就是假面超人比恩的面具。

小蘭和園子聊著幼稚園時的往事，新一當時所做出的櫻花名牌推理，正是他的第一次推理，而在小蘭不知道的情況下新一一直在背后默默地守護著她。櫻花班班主任江舟論介看小蘭的眼神讓新一非常在意，他認為這個老師是故意想要和小蘭親近，他所作出的解釋看似合理，但新一依舊無法放松警惕，新一的父親工藤優作得知后也展開了調查。

米小圈要去扔垃圾，忽然看到門口還有一個大箱子，還以為是自己家的垃圾，他很快將這個箱子一起推到電梯口，箱子是鄰居的，開門拿東西卻看到紙箱被人推到電梯口，因為急著回屋接電話，匆匆忙忙出來看到箱子又被人給推到電梯口了。米小圈也很奇怪，明明把紙箱帶到電梯口兩次，卻轉眼莫名又回來了，終于將對面鄰居抓個現行，鄰居摘下眼鏡告訴米小圈，他是個作家，擔心米小圈不相信還把自己出的書給他看。對照了書上的照片之后，米小圈對作家非常膜拜，原來名人就住在自己隔壁。不久，米小圈的作文被登到雜志上，同學們羨慕得不行，米小圈卻自嘲這有什么，他將來是要當作家的，同學們紛紛嘲笑他吹牛，讓米小圈出版一本書給他們看看。米小圈從來沒有寫書的經驗，寫一本書至少要好幾萬字，爸媽也沒有寫作的經驗給米小圈出的主意都沒有可行性，米小圈忽然想到隔壁還有個大作家可以用，立刻登門拜訪。已經過了飯點，大作家還沒有吃飯，看到米小圈要磕頭拜師，大作家立刻擺擺手，讓他不要搞這些形式主義，說著打了一個餓嗝，看到師父餓了，米小圈立刻跑回家找方便面火腿腸，媽媽看到米小圈要送拜師禮，立刻將家里僅剩的牛肉罐頭拿給米小圈。作家吃了牛肉罐頭，開始認真給米小圈教導如何