平次陪同和葉一起來到東京，準備約小蘭與柯南一起去看彩燈。由于和葉要幫助小蘭一起做飯，平次和柯南便去樓下的白羅咖啡館打發時間。二人來到咖啡店閑聊，隔壁桌是四位來咖啡館慶生的大學生。為了一起觀看慶生視頻，其中一名男學生掏出了筆記本電腦，不料卻在插上電的一瞬間導致總閘跳閘，咖啡店內瞬間一片漆黑，并有人發出一聲慘叫。當店員急忙重新打開總閘時，眾人卻發現該名男學生倒在了血泊之中……

7年前杯戶街上發生了一起搶劫殺人案，案件當時只有一個目擊證人，那就是5歲的小女孩友里未央奈。7年后小五郎帶著蘭和柯南一起來到鳩笛莊度假，友里未央奈正是鳩笛莊女主人的女兒。來度假的客人井出正也無意間談起了7年前很熱門的特攝劇彗星假面超人比恩，這讓友里未央奈陷入了恐慌之中，因為當年那起搶劫殺人案的犯人戴的就是假面超人比恩的面具。

一天，李黎給米小圈出了一道腦筋急轉彎，一道題里面有十個大爺，問哪個大爺偷了錢，米小圈正絞盡腦汁想到底哪個大爺偷走了錢，還讓同學們紛紛出來情景演繹，就在這個時候，班級里忽然來了不速之客，對方小小的個字，說話卻非常苛刻，并且對同學滿臉不屑，米小圈對這個不懂禮貌的小屁孩非常反感，就在這個時候班主任魏老師來了，給班上的同學介紹，這時他們班新傳來的學生王聰聰。聽說這個王聰聰總是跳級，從一年級直接跳到三年級，貌似天資異稟，智能超強，米小圈才對此不感冒，沒過幾天，語文老師提到民間習俗對對聯，米小圈本來對自己的對子特別自信，可是王聰聰話音一轉，直接成了公然嘲諷，同學們立刻哄堂大笑。米小圈也有了新的綽號“方大方”，米小圈對新來的同學恨得咬牙切齒。沒過幾天，姜小牙在課間吹噓父親剛剛買了新車，家里又碩大的別墅，這輛新車只是開進院子就需要半個小時。旁邊一直有小朋友發出驚訝艷羨的感嘆，王聰聰卻笑問有一樣東西，上可以貼著天，下可以貼著地，問這樣東西是什么，眾人開始迷惑不解，王聰聰抑郁成績，就是嘴巴。大伙哄然大笑，姜小牙的臉都綠了。米小圈和姜小牙對王聰聰恨得牙齒癢癢，他們慫恿李黎統一戰線也給王聰聰一點厲害，但王聰聰

柯南在靈車中發現了遺失的遺囑，小蘭和少年偵探團趕到會場后才發現葬禮已經結束，而靈車正開往火葬場。情況十萬火急，小蘭等人在尸體火化前趕到了火葬場，而棺材內卻并沒有找到柯南，在大家束手無策時又傳來了柯南的訊息。靈車有兩輛，而載著柯南的老舊靈車正駛向報廢場，在不知道靈車內有人的情況下柯南的處境十分危險。

柯南醒來后發現自己身在一個狹小黑暗的空間里，眼睛漸漸習慣后他才發現自己被困在了棺材里，能聽到風聲這一點證明他還沒被埋起來，暈倒前的一幕幕也漸漸想了起來。毛利小五郎最近接到了一起案子，律師事務所保險柜被撬，存放在里面的遺囑不見了，這是過世的塘橋集團會長的遺囑，這件事與柯南的遭遇是否有聯系呢？