混凝土殺人事件還未解決網(wǎng)上就已經(jīng)鬧得沸沸揚(yáng)揚(yáng)，說(shuō)是案件真兇是外星人而警察在故意隱瞞外星人的存在，將案件告訴過(guò)毛利小五郎的千葉警官為此被訓(xùn)斥了一番。柯南可以確定的是這起案件是人為的殺人事件，在走訪犯罪嫌疑人朽木后柯南有了線索，到底朽木是用什么方法殺了被害人呢？

為了和靈魂偵探堀田凱人進(jìn)行對(duì)談，柯南跟著毛利小五郎來(lái)到了酒店，但到時(shí)發(fā)現(xiàn)堀田已被殺害，其隔壁房間的客人竟然是世良。柯南和世良在案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)進(jìn)行了一番調(diào)查，罪犯的手法與關(guān)鍵性的證據(jù)全被找了出來(lái)，就在柯南準(zhǔn)備和往常一樣進(jìn)行推理時(shí)卻發(fā)現(xiàn)自己的變聲器不見(jiàn)了，而這時(shí)竟有人很自然的用他遺失的變聲器開(kāi)始模仿小五郎的聲音進(jìn)行推理。

阿笠博士中獎(jiǎng)拿到了餐飲券，少年偵探團(tuán)便跟著來(lái)到了位于米花百貨商店頂樓的高級(jí)餐廳，但是那里的主廚卻被人刺中腹部受到重傷。柯南見(jiàn)狀馬上聯(lián)系了百貨商店各處的偵探團(tuán)成員，正在挑選禮物的步美等人立馬去樓梯口尋找犯人的下落，但當(dāng)警察來(lái)后他們?nèi)说淖C詞卻完全不一樣。

根據(jù)死者背包中的贓物，秀一判斷該死者可能是一名搶劫犯，同時(shí)他發(fā)現(xiàn)還有一名嫌疑犯在逃。柯南在秀吉的幫助下帶來(lái)了三名有作案嫌疑的游客，經(jīng)過(guò)秀一的推理，真相很快浮出水面，警方也順利抓獲了犯罪嫌疑人。至此，柯南終于回憶起十年前與世良初次相遇的情景，同時(shí)他也意識(shí)到，世良可能已經(jīng)知曉自己的真實(shí)身份。

為了紀(jì)念戰(zhàn)國(guó)武將信長(zhǎng)入主岐阜城450周年，偵探少年團(tuán)和阿笠博士來(lái)到岐阜市內(nèi)游玩。在光彥的提議下，眾人共同觀看了當(dāng)?shù)氐挠⑿坌惚硌荨１硌萁Y(jié)束后，光彥因想得到簽名而獨(dú)自返回觀看場(chǎng)所，然而他卻在尋找表演人員的過(guò)程中遭到綁架……與此同時(shí)，在博物館展出的信長(zhǎng)公像也一并失竊。光彥能否獲救？柯南眾人尋盡線索，希望迅速找出幕后黑手。