利用步美找到的暗號(hào)解讀表，柯南本以為能順利解開(kāi)暗號(hào)，不料卻遇到了瓶頸。正當(dāng)此時(shí)，若狹老師再次拜托少年偵探團(tuán)前往舊倉(cāng)庫(kù)尋找石灰。來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)的眾人發(fā)現(xiàn)倉(cāng)庫(kù)一片狼藉，在若狹老師不經(jīng)意的提示下，柯南終于解開(kāi)了暗號(hào)的含義，并推測(cè)犯人將再次來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)。為了避免打草驚蛇，柯南設(shè)計(jì)誤導(dǎo)犯人，并在深夜與若狹老師等人再次來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)，柯南能否順利將犯人一網(wǎng)打盡？

柳龍和蕭塵宇找到唐三和小舞，柳龍對(duì)唐三出言不遜，唐三使出控鶴擒龍的絕招襲擊柳龍，他疼地大呼小叫，蕭塵宇假惺惺向小舞賠罪，要把小舞帶回去當(dāng)寵物兔養(yǎng)，小舞剛想發(fā)作，唐三急忙攔住她。蕭塵宇逼唐三把小舞交出來(lái)，然后加入他的武社，唐三斷然拒絕，蕭塵宇下令活捉那只幼小的斑斕貓，沒(méi)等柳龍出手，唐三炮突然出現(xiàn)，后面緊跟一條曼陀羅蛇，把蕭塵宇和身邊的侍衛(wèi)打得七零八落，小舞趁機(jī)攙著唐三逃走。玉小剛突然出現(xiàn)，讓唐三和小舞跟緊他，以免再遇到麻煩，小舞一心想回去救那只受傷的斑斕貓，玉小剛勸她趁早死心，他發(fā)現(xiàn)斑斕貓被曼陀羅蛇咬傷，就順著痕跡找到蛇的巢穴，讓唐三炮把蛇激怒，引到了蕭塵宇他們身邊，才讓唐三和小舞得以脫身。玉小剛覺(jué)得這條曼陀羅蛇很適合唐三，讓他把蛇殺死吸取魂環(huán)，小舞提出質(zhì)疑，唐三對(duì)玉小剛深信不疑。玉小剛想等蕭塵宇和蛇兩敗俱傷的時(shí)候出手，蕭塵宇和柳龍漸漸不敵，他們嚇得落荒而逃，曼陀羅蛇突然襲擊了玉小剛，玉小剛讓唐三出手殺蛇，唐三上下翻飛，使出暗器鐵釘襲擊蛇，結(jié)果被打翻在地，唐三使用紫金魔瞳刺瞎蛇的眼睛，然后再用鐵釘刺穿了蛇的喉嚨，曼陀羅蛇應(yīng)聲倒地死亡，頭頂上現(xiàn)出黃色的魂環(huán)，唐三知道這條蛇至少有400年的法

根據(jù)友寄夫人的回憶，寫(xiě)有打開(kāi)機(jī)關(guān)盒方法的紙條被丈夫藏在了某本書(shū)中，眾人紛紛開(kāi)始查閱圖書(shū)館中的藏書(shū)。柯南在回憶友寄夫人所言之后，頓悟了紙條被藏匿的方法，并推理出紙條所在的書(shū)籍。正當(dāng)眾人齊心協(xié)力想要從書(shū)中找出紙條時(shí)，圖書(shū)館突然停電陷入一片黑暗，柯南等人趕緊前往放置機(jī)關(guān)盒的展廳，卻發(fā)現(xiàn)基德早已留下卡片逃之夭夭。

日暮警官有事求助于小五郎，最近一件殺人案讓他非常苦惱。舞濱龍二是文學(xué)家靈岸雄高的外甥，靈岸先生在家被人謀殺，根據(jù)目擊者的證詞，警方鎖定犯罪嫌疑人就是舞濱龍二。但就在離起訴期只剩兩天的時(shí)候，舞濱龍二突然推翻之前的證詞，說(shuō)靈岸先生被害那晚他正在自家附近實(shí)施入室搶劫，受害者的證詞也證明了這點(diǎn)。靈岸家與舞濱家距離有一個(gè)多小時(shí)的車(chē)程，舞濱龍二到底是怎么錯(cuò)過(guò)時(shí)間差實(shí)施殺人犯罪的，這讓日暮警官百思不得其解。

毛利小五郎收到了一本未出版的圖畫(huà)書(shū)，柯南發(fā)現(xiàn)書(shū)上的內(nèi)容與近日發(fā)生的爆炸案有關(guān)。目暮警官得知此事后，帶著圖書(shū)作者的編輯趕到了現(xiàn)場(chǎng)。根據(jù)編劇所言，圖書(shū)作者已因病去世，而引發(fā)爆炸案的嫌疑人正是圖書(shū)作者的哥哥。通過(guò)書(shū)上的線索，柯南和毛利小五郎找到了藏匿在公園的炸彈，并被告知還有其他炸彈存在，柯南能否化險(xiǎn)為夷找出其余的炸彈？