新田太太在路上偶遇買蛋糕的柯南和小五郎，于是，她急忙將小五郎拉到自己鄰居山本的住所，拜托他處理山本自殺的案件。從現(xiàn)場來看，死者山本是坐在沙發(fā)上，嘴巴大張用自己的改裝手槍結(jié)束生命，同時(shí)在扣動(dòng)扳機(jī)的瞬間也打破了裝有蝴蝶的恒溫箱，柯南認(rèn)為這是一起謀殺案，但是兇手是如何讓死者嘴巴大張，從而營造出自殺狀態(tài)？

小五郎要去參加米花街業(yè)余文藝會(huì)演，于是便與柯南，目暮警官和街道主管上島長郎一同前往會(huì)場。途中，小五郎等人順路去了目黑美彌開的飯館。大會(huì)結(jié)束后，只剩下了有人找的市松留了下來。小五郎，上島等人則去咖啡館“meruhenn”繼續(xù)第二攤。不久后目暮警官卻接到電話報(bào)告說市松被刺！最終在柯南的推理下終于揭開了事件的真相。

深夜從酒館醉醺醺出來的小五郎在回家的路上差點(diǎn)被建筑鋼條砸死，回到家后又收到了一條恐嚇?biāo)亩绦牛驮谒叵肱c誰結(jié)仇的時(shí)候，小蘭發(fā)現(xiàn)這根本不是小五郎的手機(jī)，外套也是一個(gè)叫木村的，雖然被威脅的人不是自己的爸爸，但小蘭還是很擔(dān)心，在第二天調(diào)查的時(shí)候突然有一輛卡車沖向他們，所幸躲得快才沒有受傷，調(diào)查不斷深入，柯南察覺到了其中的端倪……

某天，一個(gè)自稱杉森政人的作家找到小林老師，說想要采訪少年偵探團(tuán)，得知這個(gè)消息后，元太、步美和光彥三人盛裝打扮，大家在小林老師的帶領(lǐng)下來到了杉森家，卻發(fā)現(xiàn)他的頭部遭人重?fù)簦阉烙诩抑校浇?jīng)過調(diào)查將嫌疑人士鎖定于在答錄機(jī)中留言的四人，而在這期間，讓柯南頭大的不止有案情還有一臉疑惑看著柯南推理的小林老師。

大家找到校長詢問他下雨的時(shí)候是否出現(xiàn)在操場，沒想到卻得到了否定的回答，為了證實(shí)校長的說法，柯南又來找了在保健室休息的世古國繁，因?yàn)樗c保坂從小一起長大，所以又了解了更多關(guān)于保坂的事情，這時(shí)，小蘭在走廊的木板上發(fā)現(xiàn)污漬，柯南將這些污漬與操場上出現(xiàn)的刮痕相聯(lián)系，沒錯(cuò)，制造靈異事件的就是那個(gè)人!