大和警官和柯南等人立刻找到剩下的三個(gè)嫌疑人展開(kāi)詢問(wèn)，可是每個(gè)人都有不在案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)的證明，與此同時(shí)，只身一人在公館思考赤壁之謎的高明遭到了兇手的襲擊，在失去意識(shí)之前他向大和傳了一條“孔明之死”的訊息，當(dāng)柯南他們趕到公館后這里已是熊熊大火，所幸上原由衣及時(shí)將高明救出，把他送到醫(yī)院的時(shí)候，小蘭對(duì)醫(yī)生們不同顏色的衣服表示好奇，而這個(gè)問(wèn)題正好給了柯南和大和提示，讓他們破解了赤壁之謎！

柯南和小蘭在東都環(huán)狀線列車上遇見(jiàn)了一位見(jiàn)義勇為的老人，然而，沒(méi)想到當(dāng)他們?cè)俅我?jiàn)面時(shí)卻是在殺人現(xiàn)場(chǎng)，死者是詐騙集團(tuán)的通緝犯，而這位名叫法月的老人正是此案的目擊證人，他說(shuō)自己曾看到同是詐騙犯的桐谷出沒(méi)案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)，但桐谷卻大喊冤屈，期間，柯南察覺(jué)到老先生法月的證詞有疑點(diǎn)，深入調(diào)查后，真相果然如他料想一般。

小五郎帶柯南和小蘭去菜園屋頂?shù)臅r(shí)候，發(fā)現(xiàn)了其中一塊菜田主人中村的尸體，表面上看像是因?yàn)槟_底打滑磕到了后腦勺的意外死亡，但柯南察覺(jué)到了其中的蹊蹺，警察找來(lái)屋頂菜園的其他三名種植者進(jìn)行偵訊，每個(gè)人都沒(méi)有不在場(chǎng)的證明，并且其中一人的供詞卻引起了柯南的注意，當(dāng)大伙兒再次來(lái)到菜園進(jìn)行現(xiàn)場(chǎng)調(diào)查時(shí)，柯南發(fā)現(xiàn)了一塊奇怪的磚頭，而這無(wú)疑是找出兇手的關(guān)鍵線索。

就在兇手企圖用球棒襲擊被騙到音樂(lè)室的小林老師時(shí)，他卻反過(guò)來(lái)被小林老師撂倒，這時(shí)，少年偵探團(tuán)和白鳥(niǎo)警官出現(xiàn)，原來(lái)小林老師早已被白鳥(niǎo)警官所保護(hù)而眼前這個(gè)人正是佐藤警官，期間，小林老師想起了以前在書店發(fā)生的事情，誤會(huì)消除的二人重歸于好。麒麟角是鈴木次郎吉在山中寺廟發(fā)現(xiàn)的寶物，而基德又以此為目標(biāo)出了預(yù)告函，次郎吉率領(lǐng)基德無(wú)法喬裝的少年偵探團(tuán)以及進(jìn)行直播的工作人員來(lái)到寺廟，麒麟像被藏在寺廟的立柱中間，想要拿取它并非易事……

白鳥(niǎo)警官記憶中的少女小林老師在煙火大會(huì)的夜晚目擊了一場(chǎng)謀殺案件，作為證人的她向白鳥(niǎo)警官提供了三條線索即兇手和死者爭(zhēng)執(zhí)的聲音、疑似搬家公司的貨車以及兇手的背影，在警局接受偵訊的期間，小林老師無(wú)意中得知白鳥(niǎo)警官曾追求過(guò)和自己很像的佐藤警官，這個(gè)消息沉重打擊了小林老師，難道自己只是佐藤警官的替身？抱有這樣想法的她該如何面對(duì)白鳥(niǎo)警官。