毛利一家大早上就來(lái)到了白羅咖啡廳，安室特制的蛋糕是店里的招牌，但打開(kāi)冰箱后卻發(fā)現(xiàn)蛋糕融化了。少年偵探團(tuán)聽(tīng)到柯南在白羅咖啡廳便全跟了過(guò)來(lái)，得知蛋糕融化后他們都很失望，為了讓伙伴們吃到安室的蛋糕柯南準(zhǔn)備著手調(diào)查此事，經(jīng)過(guò)了幾天的監(jiān)控他們并沒(méi)有找到原因，這起蛋糕融化事件的真相到底是什么？

唐三放心不下父親唐昊，知道他是因?yàn)樗寄钏廊サ钠拮尤貌湃杖战杈茲渤睿脐唤杩诨貋?lái)拿那根針，和唐昊依依惜別，唐昊答應(yīng)以后不再喝酒，對(duì)唐三千叮嚀萬(wàn)囑咐，唐三發(fā)誓要做最厲害的魂師，希望學(xué)成歸來(lái)唐昊能把母親的事全部告訴他。村長(zhǎng)帶著唐三很快來(lái)到諾丁魂師學(xué)苑，自稱(chēng)大師的玉小剛在門(mén)口悠然自得看書(shū)，他檢驗(yàn)了唐三的武魂就放行，學(xué)員柳龍卻攔住了唐三，對(duì)他冷嘲熱諷一番，逼他拿出推薦信，唐三沒(méi)有推薦信，素云濤事先給了他一塊武魂殿的推薦令，讓他直接來(lái)學(xué)苑當(dāng)附課生，而且學(xué)費(fèi)和食宿全免，柳龍對(duì)唐三出言不遜，要把村長(zhǎng)趕走。蕭塵宇及時(shí)趕來(lái)為唐三解圍，他是諾丁城城主的兒子，是唐三的同門(mén)，熱情歡迎他入學(xué)，還幫他安排好宿舍，村長(zhǎng)才放心離開(kāi)了。蕭塵宇聽(tīng)說(shuō)唐三是武魂殿推薦的，斷定他的武魂是很特別的，唐三承認(rèn)是藍(lán)銀草，柳龍對(duì)這個(gè)廢武魂嗤之以鼻，唐三自詡天生滿武魂，蕭塵宇和柳龍立刻驚呆了，斗羅大陸上很少有人擁有天生滿武魂。玉小剛立刻追上唐三，根據(jù)他的研究推測(cè)唐三應(yīng)該不止一個(gè)武魂，所以他苦苦追問(wèn)唐三的另一個(gè)武魂，唐三想起父親的囑托，他找各種借口掩飾，玉小剛知道他在說(shuō)謊，也沒(méi)有多問(wèn)，就帶他去辦入學(xué)禮，還簡(jiǎn)單介紹了學(xué)苑的情況，玉小剛讓唐三

毛利小五郎受久須美工械廠社長(zhǎng)的委托，調(diào)查工廠零部件被偷的案件，為了不引起職員的警惕，柯南和小蘭也一同隨行假裝參觀。在對(duì)職員們暗中調(diào)查后，行為怪異的谷崎成為毛利小五郎的懷疑對(duì)象，三人計(jì)劃在倉(cāng)庫(kù)抓住罪犯的現(xiàn)行，不料卻發(fā)現(xiàn)谷崎死在了反鎖的房間里。正當(dāng)案件一籌莫展時(shí)，谷崎生前研究的老鼠機(jī)器人引起了柯南的注意。

高木警官突然來(lái)電要找柯南，他說(shuō)柯南是殺人事件的知情人。畫(huà)家北園青峰下午三點(diǎn)半左右在家被人殺害， 警方為了確定嫌疑人之一北園先生的弟子西山大樹(shù)的不在場(chǎng)證明把柯南叫來(lái)，因?yàn)槭掳l(fā)當(dāng)日西山將柯南和朋友們作為模特畫(huà)了一幅風(fēng)景畫(huà)。北園先生的兩位弟子和妻子都似乎與北園先生有過(guò)糾紛，這次的案件讓警察們陷入困局。

柯南等人來(lái)到方斗寺調(diào)查會(huì)預(yù)知未來(lái)的佛像一事，因天色已晚便決定在寺院內(nèi)留宿。正當(dāng)眾人享用晚飯時(shí)，突然從房?jī)?nèi)傳出一聲慘叫，原來(lái)是正在房中念經(jīng)的住持被人殺害。毛利小五郎通過(guò)柯南在院內(nèi)找到的一些線索，推斷出了兇手的身份，然而正當(dāng)兇手跪地坦白自己的罪行時(shí)，柯南突然發(fā)現(xiàn)案件并沒(méi)有結(jié)束……