書院承諾，只要考上本院便可分文不收，還保證中舉。正在紀曉嵐驚詫之時，窮書生徐有慶闖進考場，痛斥科舉考試的黑暗之處。紀曉嵐感嘆徐有慶才智兼備。經小月打探，此書院的贊助人為“驢肉先生”。紀曉嵐堅信其中有蹊蹺，決定追查下去。紀曉嵐與小月在一驢肉館遇到在此做工的徐有慶，徐有慶表示當今科舉考試已成為牟利賺錢的營生，清白的讀書人都以此不齒。紀曉嵐帶和珅來到坐落于驢肉胡同的和珅故邸，回想舊日辛酸，和珅承認自己就是驢肉先生以及自己愛才助才的苦心，并將紀曉嵐帶至書院。紀晚嵐驚訝地發現徐有慶就在其中，但言語卻猶如陌生人。紀曉嵐設局，讓乾隆假扮店小二以聽到和珅興辦書院的目的。和珅坦言，興辦書院只為培養自己勢力，治學是假，謀私是真。乾隆大怒，罰和珅承擔此次恩科考生的所有費用，并讓紀曉嵐頂替和珅管理書院。和珅到處去宣揚自己傾囊治學。當得知乾隆親自命題時，和珅買通乾隆身邊的太監王喜偷題。

京城里彌漫著一種神秘香氣，由于來勢突然朝廷內外俱驚。乾隆命和珅迅速查明香氣源頭。一神秘女人，自稱知道香氣由來，原來紀曉嵐為了撰寫《四庫全書》而廣征天下藏書，好友顏驥踴躍獻書。和珅卻大興文字獄。乾隆在和珅的煽動下，將顏驥全家賜死。紀曉嵐無力回天，只有將顏驥生前收藏的西域煙草點燃，以此明志要為顏驥討回公道，也正是此獨特香氣使全城大亂。昔日神秘女子正是顏驥流落在民間的私生女顏如五。如玉認為一切都因紀曉嵐而起，決定替父報仇，紀曉嵐扮作戲子，在戲臺之上拿出乾隆賜予的金煙桿，表明要為顏驥翻案的決心。

經過一番教訓，和確實學乖了，不僅對金大爺俯首帖耳，對小月、莫愁亦小心翼翼，紀曉嵐剛剛抵達王廷贊的別院，他又滿臉是笑地表示歡迎，事出意外，紀曉嵐不知他是何居心，反倒不便立刻搜查藏在其間的帳本。 為擺脫和的瞎摻和，與紀曉嵐一見如故的金大爺設計誘和返回軍營，豈料和并非省油燈，胡攪蠻纏，一心要撈些便宜。負隅頑抗的王旦望將之視為突破口，不惜以百萬銀票和義女作為禮物收買和，和向來見錢眼開，憚于紀曉嵐的精明犀利，未敢輕舉妄動。 從帳本上看，根本找不到一絲一毫王旦望涉案的證據，而王廷贊亦只肯交代一些無關緊要的小官小吏，語多躊躇，紀曉嵐苦心意旨，向其點明利害。 王旦望氣急敗壞，雇兇刺殺紀曉嵐。殺手聞知眼前之人乃當今第一才子，加之其身上又佩帶著一個特殊的荷包，便慨然將他放走。

軍豪不愿見到朝中大亂，黎民涂炭的悲劇出現，冒死諫阻。忠言逆耳、皇上大怒。莫愁以家國為名，表示愿放棄兒女之情，并險些喝下墮胎之藥。幸虧紀曉嵐以三寸不爛之舌，說服她靜待時日，總有一天可以破鏡重圓。皇上寧為玉碎，不愿瓦全，斷然拒絕墮胎入宮的提議，要帶莫愁奔走天涯。和與紀曉嵐難得默契合作，強行挽留住了他的腳步。 中秋佳節，皓月當空，卷帙浩樊的《四庫全書》編纂工作大功告成，皇上應邀來閱微草堂，與兩情相悅的莫愁團圓依偎在一起。和、太后先后亦登臨紀府，異口同聲要求皇上回宮。正鬧得人仰馬翻之際，莫愁突然動產，生死攸關，太后以過來人的經驗竟擔當起接生婆的工作。 小皇子呱呱落地，眾從如釋重負。等著嗷嗷待哺的孩子，太后身上的母性復蘇，破天荒地承認了這是皇家血脈，一樁延宕多日，屢經曲折的姻緣終于名正言順，成為事實。 皇恩浩蕩，軍豪恢復狀元名號與小月重修百年之好，豐紳殷德亦接受賜婚，與十八格格結為夫妻。勞苦功高的紀曉嵐，則被賜賞了一桿金煙袋，作為“尚方寶劍”。從此，天下的貪官污吏任紀曉嵐敲打，天下的不平之事由紀曉嵐主持公道……"

戲園被圍，福康安領兵搜查后臺，紀曉嵐自言貪戀風情，才流連忘返，極力為莫愁、小月開脫罪名，且出謀劃策，鼓勵二人告倒贓官、為民伸冤，聽得與此案有干系的和與福康安是心驚肉跳。 四姑娘探知皇上要微服去燕城尋母，慫恿十四王爺借機取而代之；和等為自身利益謀，深怕失去對自己寵幸有加的保護傘，極力阻撓皇上出行。不想皇上尋母心切，哪里聽得進去。并邀小月、莫愁和紀曉嵐相伴，風塵仆仆直往燕城而去。一路所見，多是當地災民之慘狀，頗為痛心疾首。亦下定決心，要紀曉嵐查清事實，嚴加處置那些魚肉百姓的貪官污吏。 一行人初到燕城，與守城衛兵發生沖突，雙方大打出手，為免泄露身份，紀曉嵐與小月、莫愁與“許仙”各扮夫妻住進“天龍客棧”。客棧掌柜被蒙蔽，誤將他們認作是“軍機大臣和”。 和、福康安合謀利用十四王爺篡位之野心來轉移皇上的注意力。 莫愁無意間由“許仙”手中的一把折扇了解到眼前之人乃是九五之尊的當朝天子，不禁百感交集，日思夜想為民除害，未知一國之君近在眼前。