忍者學校的畢業考試就要開始了，筆試過后便是實技考試，各方面都很優異的博人很輕視這次的考試，他認為只要是考試就能輕松通過。實技考試開始了，監考老師有志乃、木葉丸和紅豆老師，而六代火影卡卡西也親自到場，雖然老師們展示出了前所未有的威壓，但過于自信的博人卻并沒有當回事兒。

鳴人被大筒木一族困在神樹，桃式瘋狂抽取九尾查克拉，并嘲笑忍者是他們的查克拉口糧。佐助和我愛羅、長十郎、黑土、達魯伊以及博人突襲大筒木基地，鳴人和博人父子倆終于相互理解，鳴人的忍道同樣激勵了博人。桃式眼看戰局不利，吞食了大筒木同伴的力量，爆發終極殺手锏。"

大筒木一族三人突襲中忍考試會場，目的是回收鳴人的尾獸查克拉重新種植神樹，煉制長生不老的丹藥。佐良娜險些被大筒木金武襲擊，佐助登場救女兒。鳴人被大筒木桃式一腳踢飛，博人用科學忍具接連反擊，力量卻被對方吸收據為已用。鳴人開啟九尾模式對抗大筒木，他守護村子的身影感化了博人。

最近一連串的事件牽扯出了根的殘黨，佐井在秘密研究所找到了線索。與此同時，早已清楚真正犯人是誰的巳月向博人透漏了消息，但博人卻怎么也不愿相信，因為操縱暗影的竟然是他們的班長堇。在遭到佐井抓捕時堇召喚出了鵺，狂暴的鵺勢必會給村子帶來災難性的打擊，巳月接到的任務是殺掉堇從而停止鵺的活動，面對這種局面博人又會做出怎樣的選擇？

任務中的佐助遭到了襲擊，而襲擊他的少年竟然有著寫輪眼。收到佐助的訊息后鳴人知道這次事件的嚴重性，他和佐助約定了見面的地點后立即出發，碰巧聽到的佐良娜打算跟過去。佐良娜和悲劇女主綜合癥發作的蝶蝶一起追趕鳴人，在途中她們遭到了攻擊，襲擊她們的正是佐助遇到過的寫輪眼少年。