阿笠博士和少年偵探團(tuán)一起去看sprite的球賽，然而在最后關(guān)頭sprite卻輸?shù)袅吮荣悾谑牵恍腥藥е吐涞男那榍巴儇浌荆驗(yàn)殡y以接受事實(shí)而獨(dú)自一人留下，可在踢球的時(shí)候因摔倒而短暫暈厥過去，待他醒來撿球的時(shí)，卻發(fā)現(xiàn)了之前在停車場(chǎng)結(jié)識(shí)的德國人滿頭是血，讓人疑惑的是他在陷入昏迷之前一直指著元太，所幸柯南破解了他留下來的訊息并將嫌疑人鎖定在三人之中。

在FBI制定作戰(zhàn)計(jì)劃的同時(shí)黑暗組織就已經(jīng)展開了行動(dòng)，他們以南田陸道的名義寄給FBI一盆花，就在柯南推測(cè)敵人的意圖時(shí)，杯戶中央醫(yī)院突然涌來大波病患，這無疑也是黑暗組織的安排，在處理完花盆里埋的炸彈后，醫(yī)院陸續(xù)出現(xiàn)送貨員，而這些貨物全部都是黑暗組織送的炸彈，如果醫(yī)院爆炸，后果不堪設(shè)想，柯南和赤井秀一又會(huì)采取什么行動(dòng)？

30年前，莊堂胡桃被一位少年從車禍中救回一命，如今，她想把偶然中得的一億獎(jiǎng)金轉(zhuǎn)送給自己的恩人，線索就是少年身上巨大的疤痕以及夏日海灘的記憶，期間，有兩名男子前來認(rèn)領(lǐng)，為了辨認(rèn)誰才是正牌貨，柯南他們來到了莊堂家，沒想到在這里碰到了正在追查快要超過追訴期的殺人案的目暮警官，因?yàn)槟敲麅词稚砩弦灿幸坏纻邸．?dāng)晚，小五郎泡澡的時(shí)候，發(fā)現(xiàn)管家保谷泰輔背上有一道傷痕，胡桃回憶中的少年究竟是誰呢？

傳說中的幽靈鬼屋里住進(jìn)了一個(gè)奇怪的大叔，但當(dāng)柯南他們趕去調(diào)查時(shí)看見的卻是整齊的庭院。不幸的是這個(gè)整理庭院的大叔第二天就因病去世了，在庭院門口，少年偵探團(tuán)遇到了前來取畫的畫商并從他的口中得知住在這里的人是畫家和田，可是大家找遍了房子也沒能找到畫作，就在他們要放棄之時(shí)，來了兩名前來看畫的客人，而這個(gè)人正是和田失憶的阿姨，為了讓疼愛自己的阿姨恢復(fù)記憶，和田到底創(chuàng)作了怎樣一幅畫？

柯南，小哀，步美等人與阿笠博士一同去了SFMP4電影《星劍戰(zhàn)記Ⅵ》的試映會(huì)。開場(chǎng)前，排著隊(duì)的柯南等人結(jié)識(shí)了攝影師建井文吾。原來，建井是這部電影的忠實(shí)影迷，他和女友亞美就是在這部電影的試映會(huì)上相識(shí)的。而這時(shí)建井卻突然接到電話走開，他不自然的行為引起了柯南的注意，最終柯南讓俺們阻止了建井的復(fù)仇行為并解開了建井的心結(jié)。