在銀行的出租保險(xiǎn)箱里面，躺著銀行員工園田真知子的屍體，而且外面的鐵門(mén)還拉下，在外面還貼了一張報(bào)警就會(huì)引爆炸彈的紙。新一先將屍體跟室內(nèi)的狀況拍攝下來(lái)，并且要小五郎確認(rèn)倒在里面的女子是不是真知子。小五郎表示突然接到真知子的電話(huà)，請(qǐng)他到銀行來(lái)說(shuō)有事情跟他商量，可是當(dāng)他到銀行時(shí)，真知子就已經(jīng)倒在里面...

大家一起去滑雪的時(shí)候，小五郎弄丟了別墅的鑰匙，三人正愁沒(méi)地兒住的時(shí)候，醫(yī)科大學(xué)的大山教授認(rèn)出小五郎并邀請(qǐng)他們?nèi)プ约旱膭e墅，并正巧碰上了大山教授學(xué)子們的聚會(huì)，期間，中原驅(qū)車(chē)下山買(mǎi)下酒菜，趁這個(gè)機(jī)會(huì)大家也都各自活動(dòng)，可中原回來(lái)后，卻發(fā)現(xiàn)大山教授被殺，柯南在現(xiàn)場(chǎng)根據(jù)教授留下的線(xiàn)索找到兇手。

小五郎的師傅塩田，在劇院找到了處理威脅事件的小五郎，而此時(shí)，他們正趕上女主角祥子和男主角宇田彩排一出殉情的戲碼，可祥子卻在演戲中被真正的毒殺，當(dāng)所有的嫌疑都指向和水杯有關(guān)系的館岡和中山時(shí)，塩田卻搖頭否認(rèn)，期間小五郎意外受傷而離開(kāi)。思考陷入瓶頸的柯南，從塩田突然談起的芥川龍之介的《蜘蛛絲》得到啟示，找出了兇手。

小蘭和園子去東都銀行取錢(qián)的時(shí)候，碰上了搶銀行的歹徒，他用槍威脅銀行職員谷口將現(xiàn)金裝入背包，趁歹徒放松警惕，蘇醒過(guò)來(lái)的銀行職員前島正要從背后攻擊的時(shí)候，電話(huà)鈴聲突然想起，前島被射傷，此時(shí)，銀行一片惶恐，谷口沖上去撲倒歹徒將他擊斃。當(dāng)警察趕到時(shí)，柯南注意到了電話(huà)鈴聲，他認(rèn)為此事并非單純的搶劫案，而是另有內(nèi)幕。

委托人為表示感謝，招待小五郎三人溫泉旅行，他們?cè)诖畛藴娇h的列車(chē)上，遇到了兩名爭(zhēng)吵的醫(yī)生佐藤、伊達(dá)，期間伊達(dá)曾生氣離開(kāi)。換乘休息的途中，警察在與湯之山線(xiàn)列車(chē)路線(xiàn)基本相同的花之街線(xiàn)列車(chē)上發(fā)現(xiàn)尸體，柯南洞察到伊達(dá)神情怪異有犯罪嫌疑，可他是怎么樣在兩趟不一樣的列車(chē)上游走殺人的？