警察開始調查帳篷燃燒的原因，籃球社的成員都有不在場證明。柯南從段野的證詞那里發現了奇怪之處，黑田管理官也發覺了異樣，這不是一起意外自殺，而是故意殺人事件。柯南從大家做的橡子挑擔偶人得到了啟發，懷疑是有人做了一個自動起火裝置故意暗殺了漆原史昭。

柳龍和蕭塵宇找到唐三和小舞，柳龍對唐三出言不遜，唐三使出控鶴擒龍的絕招襲擊柳龍，他疼地大呼小叫，蕭塵宇假惺惺向小舞賠罪，要把小舞帶回去當寵物兔養，小舞剛想發作，唐三急忙攔住她。蕭塵宇逼唐三把小舞交出來，然后加入他的武社，唐三斷然拒絕，蕭塵宇下令活捉那只幼小的斑斕貓，沒等柳龍出手，唐三炮突然出現，后面緊跟一條曼陀羅蛇，把蕭塵宇和身邊的侍衛打得七零八落，小舞趁機攙著唐三逃走。玉小剛突然出現，讓唐三和小舞跟緊他，以免再遇到麻煩，小舞一心想回去救那只受傷的斑斕貓，玉小剛勸她趁早死心，他發現斑斕貓被曼陀羅蛇咬傷，就順著痕跡找到蛇的巢穴，讓唐三炮把蛇激怒，引到了蕭塵宇他們身邊，才讓唐三和小舞得以脫身。玉小剛覺得這條曼陀羅蛇很適合唐三，讓他把蛇殺死吸取魂環，小舞提出質疑，唐三對玉小剛深信不疑。玉小剛想等蕭塵宇和蛇兩敗俱傷的時候出手，蕭塵宇和柳龍漸漸不敵，他們嚇得落荒而逃，曼陀羅蛇突然襲擊了玉小剛，玉小剛讓唐三出手殺蛇，唐三上下翻飛，使出暗器鐵釘襲擊蛇，結果被打翻在地，唐三使用紫金魔瞳刺瞎蛇的眼睛，然后再用鐵釘刺穿了蛇的喉嚨，曼陀羅蛇應聲倒地死亡，頭頂上現出黃色的魂環，唐三知道這條蛇至少有400年的法

平次參加了全國高中生劍道大賽，他在個人賽中獲得了優異的成績，他決心打敗對手沖田然后向和葉告白。但是事情進展的并不順利，中場休息時場外發生了一起兇殺案。裁判拔谷士道在室外廁所旁被殺害，兇手穿著京都泉心高中的劍道護具，現場沒有目擊者，只有一位雙目失明的老人聽到了聲響。

毛利一家大早上就來到了白羅咖啡廳，安室特制的蛋糕是店里的招牌，但打開冰箱后卻發現蛋糕融化了。少年偵探團聽到柯南在白羅咖啡廳便全跟了過來，得知蛋糕融化后他們都很失望，為了讓伙伴們吃到安室的蛋糕柯南準備著手調查此事，經過了幾天的監控他們并沒有找到原因，這起蛋糕融化事件的真相到底是什么？

利用步美找到的暗號解讀表，柯南本以為能順利解開暗號，不料卻遇到了瓶頸。正當此時，若狹老師再次拜托少年偵探團前往舊倉庫尋找石灰。來到舊倉庫的眾人發現倉庫一片狼藉，在若狹老師不經意的提示下，柯南終于解開了暗號的含義，并推測犯人將再次來到舊倉庫。為了避免打草驚蛇，柯南設計誤導犯人，并在深夜與若狹老師等人再次來到舊倉庫，柯南能否順利將犯人一網打盡？