電氣的忍術課成績很差，繼續下去他就要面臨留級的危機，不愿意留級的他無意間提到了一直沒能畢業的巖部。巖部并沒有因為電氣的言論生氣，他反而主動幫助不得要領的電氣，得知巖部的文化課沒有進展時電氣也伸出了援手，相互幫助的兩人都得到了提升。自信滿滿的巖部和電氣趕往考場，但在途中卻看到了火災現場。

幽靈事件解決后博人的神秘力量就再也沒有發動過，但他更擔心的是班長堇的現狀。校舍接近完工，志乃老師讓大家重新組隊進行實戰訓練，這是為了讓同學們多做嘗試，借此找到畢業后能夠一起組隊的同伴，這個時候大家都想起了缺席的堇。堇現在的狀況非常尷尬，要不要回到學校還得看她本人的意愿，為此志乃親自去探望了堇。

神樂還是沒有辦法反抗尸澄真的命令，毫無戰意的他只能朝著博人不斷地揮舞著鲆鰈，而巳月的趕到讓事情有了轉機。巳月手中的證據讓尸澄真等人私下的劣行暴漏無疑，改革也只是為了發動戰爭的借口而已，得知自己被騙的神樂非常悔恨，博人和巳月決定出手阻止尸澄真的野心，他們能將事態控制在最小范圍嗎？

白夜團利用民眾游行包圍了雷門公司，但他們真正的目的則是片助的科學忍具研究所。當大家的注意力全被雷門公司吸引時白夜團搶走了研究所的忍術資料，鹿臺意識到這一點后立即與博人等人趕了過去，他們依靠片助的跟蹤器找到了白夜團，在同伴們的掩護下鹿臺和博人追了上去，他們能阻止白夜團的陰謀嗎？

鵺與其他通靈獸的區別在于棲息環境，卡卡西推測鵺已經帶著堇前往異世界，他們無法主動干涉，而唯一可以阻止堇的只有跟過去的博人和巳月。知道了真相的博人依舊將堇看做同班同學，在他的眼里堇還是那個時刻為班里同學著想的班長。堇聽到這些后情緒發生了變化，圍繞在堇身上的黑影漸漸淡去。