阿笠博士帶柯南和少年偵探團(tuán)去伊豆的海水浴場游玩，無意中聽到了當(dāng)?shù)氐臐O夫下條和吉澤與新加入的漁夫荒卷的爭吵，雙方還約定晚上8點(diǎn)餐廳里見。但荒卷卻遲遲沒有出現(xiàn)最后被發(fā)現(xiàn)死在了沙灘上。在現(xiàn)場調(diào)查之時柯南發(fā)現(xiàn)船上留下的紐扣的疑點(diǎn)，而死者滿是劃痕的手機(jī)使柯南發(fā)現(xiàn)了犯人的真實(shí)名目，但是犯人的殺人動機(jī)又是什么呢？

看著奄奄一息的柯南，步美建議大家自己想辦法，三人按照石頭上的文字推斷出了出口方位又利用蝙蝠逃出了洞穴，歹徒也遭到逮捕。緊接著柯南被立刻送到醫(yī)院進(jìn)行治療，又在小蘭碰巧知道血型的情況下給他輸了血，小蘭最近的奇怪反應(yīng)讓柯南意識到自己的身份或許已經(jīng)在小蘭面前暴露，就在他打算向小蘭坦白時，灰原拿槍對準(zhǔn)柯南。

小五郎的事務(wù)所里來了一個叫春菜的大學(xué)生，委托小五郎找他的尋呼機(jī)朋友。春菜保存了秋悟先生的尋呼機(jī)和音樂盒，那以后，春菜的尋呼機(jī)上出現(xiàn)了奇怪的留言。小五郎一行找到秋悟的家人，卻發(fā)現(xiàn)秋悟在給春菜送出尋呼機(jī)之前就已經(jīng)死了，而走廊上還出現(xiàn)了奇怪的人影。接著眾人就發(fā)現(xiàn)已經(jīng)被擊暈的阿稔。

小五郎接受電視節(jié)目制作公司社長古川悅子的委托去保護(hù)他的母親。然后在古川家等待悅子回來的時候知道了家屬和女傭之間發(fā)生了很多金錢上的糾紛。悅子回來后去母親的房間叫母親時從母親的房間傳來了槍聲。悅子的母親被擊中頭部死亡。經(jīng)過調(diào)查，柯南發(fā)現(xiàn)了兇手殘留下來的證據(jù)正是遙控器上指紋的漏洞。最終兇手承認(rèn)了自己的罪行。

小蘭抽空和園子一起去上陶藝課，柯南暗中尾隨但被人發(fā)現(xiàn)，之后便和小蘭她們一起做陶藝，這間陶藝教室除了擔(dān)任講師的美濃先生還有他的助手笠間菊代，這時，美濃的女婿素夫剛好回來，沒有想到在他回來沒有多久竟然不見了，最后大家在倉庫內(nèi)發(fā)現(xiàn)了被人用領(lǐng)帶勒死的素夫的尸體。