為了讓扭傷腳的柯南療養(yǎng)腳傷，大伙兒一起來到城崎溫泉，然而，小蘭卻突然失蹤，柯南從光彥他們所拍的照片上看到小蘭和一個(gè)小女孩在一起，同時(shí)照片上還出現(xiàn)了一個(gè)行蹤可疑的男人。這時(shí)，柯南他們遇到了服部，他受人委托前來找一個(gè)叫陽(yáng)菜的女孩，而她正是和小蘭在一起的那個(gè)孩子。據(jù)陽(yáng)菜的父親周平所說，在陽(yáng)菜失蹤的同時(shí)他美術(shù)館里的展品彩虹之子也不翼而飛。就在大家四處進(jìn)行尋找時(shí)，陽(yáng)菜和小蘭遇到了危險(xiǎn)。

這天柯南陪同小蘭和園子來練瑜伽減肥，這時(shí)他們碰到來參加減肥班的出川，而出川厚子故意的刁難的態(tài)度迫使教練里月跪下息事寧人。而在晚上的訓(xùn)練厚子也早退走掉，獨(dú)自回到屋里。訓(xùn)練之后保子因?yàn)榍貌婚_出川的門而來找里月，但開門之后出現(xiàn)的確實(shí)中毒身亡的出川！在勘察現(xiàn)場(chǎng)之后肯納發(fā)現(xiàn)了犯人的犯罪手法，犯人也承認(rèn)了因?yàn)閳?bào)仇而殺人的事實(shí)。

案件終于有了眉目，就在柯南和大和針對(duì)謎題展開討論時(shí)，高明從昏迷中蘇醒，三人一起計(jì)劃了一出空城計(jì)。他們故意對(duì)三個(gè)嫌疑人放出關(guān)鍵信息，引誘他前去直木司郎家找重要的證據(jù)，果然不所料兇手暗中潛伏在直木司郎家附近，為了讓狡猾的他放松警惕，柯南聯(lián)合小蘭、大和等人上演了一場(chǎng)能證明周遭沒有警察的犯罪戲碼，引誘兇手自投羅網(wǎng)。

為了陪光彥把壓歲錢存進(jìn)賬戶，柯南、步美和灰原等人一起來到帝都銀行，可元太因?yàn)槌蕴辔竿戳似饋恚驮诓┦亢突以獬鲑I藥期間，一波帶著面具的搶匪突然闖進(jìn)銀行，前來取錢的茱蒂老師以及一名貌似赤井秀一的人也成為了他們的人質(zhì)，雖然茱蒂用美人計(jì)在廁所獨(dú)立擊倒一名搶匪，卻不幸被同伙發(fā)現(xiàn)，事已至此，少年偵探團(tuán)成為了將徒制服的唯一希望！

游戲公司社長(zhǎng)的恩田和美遭到兇手槍擊身亡，小流氓大嶺良介涉嫌重大因此被通緝，他在購(gòu)物中心劫持一名少女作為人質(zhì)正打算逃跑時(shí)，被柯南發(fā)現(xiàn)，他成功救出了女孩但自己卻成為了新人質(zhì)，大嶺驅(qū)車擺脫了警方的追擊，帶柯南來到一處地下室躲藏，期間，柯南試圖逃跑卻遭到不明人士的槍襲，所幸大嶺出手相救，柯南開始懷疑這個(gè)為自己負(fù)傷的人是否真的是殺人犯，或許這起殺人案的背后還隱藏著不可告人的內(nèi)幕！