紀曉嵐探望戴沾。對證之下，兩人明白是和珅從中搗鬼使兩人頻生誤會。紀曉嵐表示如玉處境危險。為救如玉戴沾只得說出真相。得知如玉的真實身份，紀曉嵐驚訝萬分。如玉到獄中懇求戴沾與自己遠走高飛，戴沾卻表示要一心潛修《四庫全書》，不愿因為兒女情長而辜負顏驥厚望。得知乾隆早已知道自己的身份，如玉表示自己也早已忘記仇恨。紀曉嵐帶太后看戲，太后驚訝地發現公主為小月扮演，而駙馬正是如玉扮演。戲中駙馬原為女扮男裝，被發現后要處以死刑，太后深為同情女駙馬，令紀曉嵐修改劇本，恕女駙馬無罪。

三個完全不同的陌路人各懷心思，只坐在同一張酒桌前。和大耍手腕，拼命拉攏迷惑對紀曉嵐產生誤解的小月，四姑娘則靜觀事態發展，伺機而動。 紀曉嵐明查暗訪，終于找到老病纏身、雙目失明的御醫呂長安。 福康安率大批官兵，興師動眾搜查德和堂藥鋪，一來是詢查呂長安下落，二來是關心丹藥的進展情況，與此同時，一對黑衣女子被小月、四姑娘發經過激烈打斗，小月被綁架。 小小的臨青州突然之間風云際會，幾路人馬蜂擁而至，勾心斗角。四姑娘伺機接近紀曉嵐，二人暗中較量，明里交鋒，紀曉嵐以詩作謎，透露煉丹藥的事，觀察四姑娘的反映，四姑娘如獲至寶，允諾立即釋放小月。 和以只談小月不談政事搪塞匆匆而至的紀曉嵐，紀曉嵐則有意遺下一紙短簽，告之呂長安藏身之地。 這天三更，紀曉嵐造訪德和堂藥鋪，向何掌柜指出煉丹藥的利害弊病，希望他以大局為重，出面保護老友兼親家的御醫呂長安。

和珅知道紙里包不住火，于是將齊蘇圖的贈銀封好，以便日后上繳以示清白。乾隆暗示銀妃要堅決查辦齊家，銀妃佯裝大義滅親，以死來表示自己不愿讓乾隆為私情所累，乾隆深受感動，表示不再追究齊家。太后此時也出面對銀妃予以袒護。劉全跟蹤紀曉嵐找到工匠住處。瘋癲的洪仁趁眾人不備跑出院子，被劉全劫持。紀曉嵐無意中發現了古大力挖的暗道。和珅惟恐自己被連累其中，于是讓劉全將工匠的藏身之處透露給齊家，再制造洪仁瘋癲之中縱火的假象以害死洪仁。小月夜闖皇宮，讓乾隆秉公執法，查辦齊家，乾隆卻表示礙于親情，無能為力。紀曉嵐再次披露齊家貪贓枉法的罪行，乾隆大怒。齊蘇圖趁紀曉嵐去給工匠送飯之機，將房子點燃。紀曉嵐等人猶如甕中之鱉。

書院承諾，只要考上本院便可分文不收，還保證中舉。正在紀曉嵐驚詫之時，窮書生徐有慶闖進考場，痛斥科舉考試的黑暗之處。紀曉嵐感嘆徐有慶才智兼備。經小月打探，此書院的贊助人為“驢肉先生”。紀曉嵐堅信其中有蹊蹺，決定追查下去。紀曉嵐與小月在一驢肉館遇到在此做工的徐有慶，徐有慶表示當今科舉考試已成為牟利賺錢的營生，清白的讀書人都以此不齒。紀曉嵐帶和珅來到坐落于驢肉胡同的和珅故邸，回想舊日辛酸，和珅承認自己就是驢肉先生以及自己愛才助才的苦心，并將紀曉嵐帶至書院。紀晚嵐驚訝地發現徐有慶就在其中，但言語卻猶如陌生人。紀曉嵐設局，讓乾隆假扮店小二以聽到和珅興辦書院的目的。和珅坦言，興辦書院只為培養自己勢力，治學是假，謀私是真。乾隆大怒，罰和珅承擔此次恩科考生的所有費用，并讓紀曉嵐頂替和珅管理書院。和珅到處去宣揚自己傾囊治學。當得知乾隆親自命題時，和珅買通乾隆身邊的太監王喜偷題。

軍豪不愿見到朝中大亂，黎民涂炭的悲劇出現，冒死諫阻。忠言逆耳、皇上大怒。莫愁以家國為名，表示愿放棄兒女之情，并險些喝下墮胎之藥。幸虧紀曉嵐以三寸不爛之舌，說服她靜待時日，總有一天可以破鏡重圓。皇上寧為玉碎，不愿瓦全，斷然拒絕墮胎入宮的提議，要帶莫愁奔走天涯。和與紀曉嵐難得默契合作，強行挽留住了他的腳步。 中秋佳節，皓月當空，卷帙浩樊的《四庫全書》編纂工作大功告成，皇上應邀來閱微草堂，與兩情相悅的莫愁團圓依偎在一起。和、太后先后亦登臨紀府，異口同聲要求皇上回宮。正鬧得人仰馬翻之際，莫愁突然動產，生死攸關，太后以過來人的經驗竟擔當起接生婆的工作。 小皇子呱呱落地，眾從如釋重負。等著嗷嗷待哺的孩子，太后身上的母性復蘇，破天荒地承認了這是皇家血脈，一樁延宕多日，屢經曲折的姻緣終于名正言順，成為事實。 皇恩浩蕩，軍豪恢復狀元名號與小月重修百年之好，豐紳殷德亦接受賜婚，與十八格格結為夫妻。勞苦功高的紀曉嵐，則被賜賞了一桿金煙袋，作為“尚方寶劍”。從此，天下的貪官污吏任紀曉嵐敲打，天下的不平之事由紀曉嵐主持公道……"