深夜從酒館醉醺醺出來的小五郎在回家的路上差點(diǎn)被建筑鋼條砸死，回到家后又收到了一條恐嚇?biāo)亩绦?，就在他回想與誰結(jié)仇的時(shí)候，小蘭發(fā)現(xiàn)這根本不是小五郎的手機(jī)，外套也是一個(gè)叫木村的，雖然被威脅的人不是自己的爸爸，但小蘭還是很擔(dān)心，在第二天調(diào)查的時(shí)候突然有一輛卡車沖向他們，所幸躲得快才沒有受傷，調(diào)查不斷深入，柯南察覺到了其中的端倪……

在趕來支援的FBI的幫助下，柯南他們將獨(dú)自駕駛摩托的水無包圍，然而，馬路上卻出現(xiàn)了一個(gè)撿球的小男孩，為不傷害小孩，水無出車禍?zhǔn)軅?。另一邊，今恩在水無換下的衣物里發(fā)現(xiàn)了粘在鞋底的發(fā)信器和竊聽器，便臨時(shí)決定變更目標(biāo)向米花鎮(zhèn)駛?cè)ィ履喜煊X到他們的行動(dòng)，意識(shí)到小五郎性命堪憂，也匆匆趕往米花鎮(zhèn)，而此時(shí)黑衣組織已經(jīng)瞄準(zhǔn)了小五郎……

柯南和小蘭跟著小五郎一起來到鹿兒島，隨后三人就立即就去拜訪一個(gè)叫高隈的制酒廠，酒廠老板娘白石扶美子帶著這三人四處參觀的時(shí)候，卻不幸發(fā)生了意外，大家在董事辰村慎介的家中發(fā)現(xiàn)地上留有一灘血，而他本人也知了去向，經(jīng)過兩天的尋找辰村的尸體在公園里被人發(fā)現(xiàn)，而酒廠的所有人都成了此次案件的嫌疑人。

柯南等人掉落屋低之后，發(fā)現(xiàn)這個(gè)別館的地下居然是一個(gè)巨大的迷宮，大家團(tuán)結(jié)一致將衣服拆開，利用毛線引導(dǎo)道路，雖然走了很多冤枉路，但還是找到了出口。而此刻距離解謎的結(jié)束時(shí)間只有三個(gè)小時(shí)，這時(shí)，窗外的一束光給了柯南提示，他跑出東之天使那里，把找到的黑色水晶按放在相應(yīng)的位置，寶藏的所在也顯現(xiàn)出來，這時(shí)，時(shí)鐘不顧一切的沖向?qū)毑?，他到底是什么人?/p>

應(yīng)社樂蓮希小姐的邀請(qǐng)，柯南等人來到音樂世家社樂調(diào)一郎的公館，蓮希拜托小五郎調(diào)查因名琴——斯托拉地巴力毆斯所引起了一連串詭異事件，然而，就在他們談?wù)摯耸聲r(shí)，旁邊的別館火舌繚繞，在那里小憩的弦三郎也因此喪生火海，大家又重回原來的房間，柯南卻發(fā)現(xiàn)了奇怪的煙蒂，在與火樓里的煙蒂對(duì)比以后，柯南認(rèn)定這并不是意外而是故意殺人，并且還將會(huì)出現(xiàn)下一個(gè)被害者。