莫愁救出的那位女子自稱是《紅樓夢》作者曹雪芹之妻湘云，因慕紀曉嵐之名，特意拜訪，希望能借助正在編纂《四庫全書》的紀大人之手，使“紅樓”重見天日。紀曉嵐與寄居其府宅“閱微草堂”的小月、莫愁為書中情節所感染，急欲一睹作者面目，一起來到香山紅葉村，眼前的景象卻著實凄涼：殘垣斷墻，人去室空，只有作者遺像懸掛在墻上。正身傷感，卻被福康安的大隊人馬圍堵，說是要搜捕反清復明的殘孽余黨。 利用《紅樓夢》這部所謂的反書，福康安落井下石，將紀曉嵐投入天牢，和幸災樂禍，假意探望。正當小月、莫愁一籌莫展，從泰山而來的皇上口諭意外地救了他們。原來太后嗜好紀府以中藥炮制的話梅，限期二日之內速送至泰安府。剛剛在第一回合的較量中占了風頭的和雖不甘就此罷休，憚于太后、皇上之命，放了紀曉嵐出獄。 湘云怕《紅樓夢》書稿被抄沒和失落，執意要求由紀曉嵐來保管，面對她的信任，紀曉嵐決心不惜身家性命，定為這部千古奇書盡了綿薄之力，使之盡早刊行于世。

紀曉嵐夜讀時又接到被扔進窗子的紙條，上面寫有郭天的消息，紀曉嵐懷疑黑衣人正是張了了。紀曉嵐夜探郭天，得到通報的和珅與盧焯眼見沒有退路，只得慌忙扮成囚犯躺在隔壁囚房。乾隆看到瑤琴乘坐的馬車很是欣喜，不料落入盧安的圈套，也被一同押走。乾隆三人被關在洞中，外面重兵把守。乾隆佯裝自殺以騙過盧安，再見機救出瑤琴。紀曉嵐終于醒悟，誓要擺脫情感糾葛，全力調查國庫虧空一案。紀曉嵐扮作江湖郎中，偶遇掌管賬本的宋司庫，以自己掌握的情況博得宋司庫信任，并抓住其惶恐的心理，以消災為由取得真賬本。和珅模不透紀曉嵐葫蘆里賣的是什么藥，便決定先下手為強，命盧安將瑤琴押回杭州以要挾郭天認罪，卻沒料到乾隆在盧安即將動身時救出瑤琴。

張了了慌稱要去探望戲園的師傅，紀曉嵐感到好奇，便跟隨前往，眼見張了了進了戲園，紀曉嵐無功而返。等候在戲園里的劉全將和珅的指示吩咐給張了了，要其依計行事，念及柳哥的安危，張了了含淚答應。張了了為南下購置了許多東西并賒了賬。小月和杏兒偷聽到盧焯命令盧安用郭天的女兒瑤琴要挾郭天冒認罪行，一蒙面人擲石提醒盧焯，小月和杏兒追趕，卻遇到了張了了，引起小月起疑。瑤琴和丫鬟春桃在進香時遭到盧安的劫持。紀曉嵐讓小月前去搭救瑤琴，和珅找尋至此，意欲勸紀曉嵐放盧焯先走，紀曉嵐巧妙利用于丑交替之時，將決定權推到和珅身上。

飛鏢乃四姑娘所為，幸虧皇上福大命大，逃過了一劫，不但未曾生疑，還與隨后而至的十四王爺探討起了有關身世的蛛絲馬跡。十四王爺支支吾吾，力主皇上立刻返回京城，切莫聽信那些流言蜚語。 聞知紀曉嵐“肆無忌憚”地冒己之名，和匆匆趕至燕城。公堂之上，二人唇槍舌劍，你來我往，辯論得不亦樂乎。和無計可施，索性把紀曉嵐關進監牢，借機嘲笑。一善一惡，一忠一奸，一賢一貪卻同為朝中重臣，皇上心腹。雖志同道不合，形如冰炭，卻因命運的機緣，還總是攪和在一起，是是非非，各執一詞。 柳志婦人驚見完好無缺的金鎖，淚盈滿面，連連感吧“我的孩子他回來了”并向皇上講述了自己當年與未繼位的四阿哥相識相戀的故事，往事悠悠，歲月如流，多少愛情情仇都已休，二人正沉浸在甜蜜又傷心的回憶不如，忽聞有人大喊“失火”，原來是小月為救紀曉嵐而來。 小月攜皇上親筆手書“生堂”字樣擊鼓鳴冤，和見皇上筆墨，豈敢抗旨，只得授意燕城知府劉常富主審紀曉嵐冒名頂替安。出人意料的是，原告小月帶來的證人竟是一身便裝的皇上。

為避免和珅從中舞弊，紀曉嵐自薦調查此事。紀曉嵐推薦不畏權勢的海升進行調查。和珅讓劉三盡快將煤窯脫手，劉三似有難言之隱。小月假扮皇室之人，與海升進山察探，表示要買下煤窯并約劉三在酒樓詳談。劉三得知后暗自慶幸，迫不及待地前去和海升商談買賣煤窯之事，被早已等候于此的紀曉嵐捉拿歸案。和珅表示自己查出劉三是開窯之人，并要求紀曉嵐從嚴查處，以示自己秉公執法。眾人規勸海升看在和珅的面上放過劉三，以給自己留后路，海升堅持要秉公處理，和珅擔心劉三供出真正的幕后主使而連累自己，于是命劉三服毒自盡。海升欲繼續調查，卻得知劉三已死并被家人拉回老家埋葬。