根據(jù)友寄夫人的回憶，寫(xiě)有打開(kāi)機(jī)關(guān)盒方法的紙條被丈夫藏在了某本書(shū)中，眾人紛紛開(kāi)始查閱圖書(shū)館中的藏書(shū)。柯南在回憶友寄夫人所言之后，頓悟了紙條被藏匿的方法，并推理出紙條所在的書(shū)籍。正當(dāng)眾人齊心協(xié)力想要從書(shū)中找出紙條時(shí)，圖書(shū)館突然停電陷入一片黑暗，柯南等人趕緊前往放置機(jī)關(guān)盒的展廳，卻發(fā)現(xiàn)基德早已留下卡片逃之夭夭。

小五郎讓柯南和小蘭陪他一起去位于大分的別府溫泉旅行，說(shuō)到別府溫泉最有名的莫過(guò)于地獄巡游之旅，就在小蘭和柯南興致勃勃討論的時(shí)候小五郎卻在一旁默不作聲。在柯南和小蘭的逼問(wèn)下小五郎才說(shuō)出了實(shí)情，這次的旅行目的是尋找仲代電氣社長(zhǎng)的女兒麻奈美，柯南根據(jù)照片找到了麻奈美所住的旅館，但這僅僅只是開(kāi)始。

柯南所在的班里來(lái)了一位新老師名叫若狹留美，若狹老師想在體育課前用石灰畫(huà)線，卻發(fā)現(xiàn)石灰已經(jīng)用完了。柯南告訴若狹老師舊倉(cāng)庫(kù)里可能有石灰，元太和光彥開(kāi)玩笑說(shuō)舊倉(cāng)庫(kù)有幽靈出沒(méi)，若狹老師感到很害怕，便拜托少年偵探團(tuán)一同前往舊倉(cāng)庫(kù)。在尋找石灰的過(guò)程中，柯南發(fā)現(xiàn)一扇通往地下的門(mén)，眾人合力打開(kāi)門(mén)后，卻驚人地發(fā)現(xiàn)了一具骸骨……

米小圈和姜小牙還有鐵頭去了器材室，本來(lái)是想在里邊逛逛，忽然發(fā)現(xiàn)桌子上放了一盒炸雞，鮮美的炸雞還冒著熱氣，鐵頭和姜小牙還有米小圈立刻大快朵頤，將炸雞吃得一塊不落的時(shí)候，米小圈百無(wú)聊賴(lài)地翻找器材，忽然看到一個(gè)神奇的怪物，嚇得他哇哇大叫，三個(gè)人連滾帶爬逃走了。課間十分鐘，姜小牙和米小圈無(wú)意中看到李黎將家里的小烏龜偷偷給帶來(lái)了，原來(lái)外表冷酷冰清玉潔的李黎也有養(yǎng)寵物的嗜好，米小圈竊喜，有了這個(gè)把柄今后她再也不能找他們麻煩了。最近班上有同學(xué)開(kāi)始追星，李黎也不例外，米小圈有一次偷偷看到李黎親手寫(xiě)的一封信，原來(lái)李黎的偶像是歐陽(yáng)樂(lè)樂(lè)，這個(gè)手腳并彈的音樂(lè)奇才，不僅有才，人長(zhǎng)得又帥，老師是不允許追星的，米小圈覺(jué)得自己又抓到了李黎另一個(gè)把柄。李黎發(fā)現(xiàn)米小圈像小狗一般總是圍著她轉(zhuǎn)，這可不是好現(xiàn)象，她很快買(mǎi)通了鐵頭，鐵頭智商根本不在線，將米小圈私下看李黎信箋的事情又給暴露了。看來(lái)要給米小圈點(diǎn)厲害了，就知道米小圈膽子小，李黎特意邀請(qǐng)他去欣賞奪命小木屋。來(lái)到奇妙小屋，李黎和米小圈都支支吾吾不敢進(jìn)去，為此他們吃巨無(wú)霸熱狗，巨無(wú)霸爆米花，最終還是被一群人的衣服給帶入奇妙小屋。這奇妙小屋中不僅有驚悚的音樂(lè)，還有一些稀奇古怪

柳龍和蕭塵宇找到唐三和小舞，柳龍對(duì)唐三出言不遜，唐三使出控鶴擒龍的絕招襲擊柳龍，他疼地大呼小叫，蕭塵宇假惺惺向小舞賠罪，要把小舞帶回去當(dāng)寵物兔養(yǎng)，小舞剛想發(fā)作，唐三急忙攔住她。蕭塵宇逼唐三把小舞交出來(lái)，然后加入他的武社，唐三斷然拒絕，蕭塵宇下令活捉那只幼小的斑斕貓，沒(méi)等柳龍出手，唐三炮突然出現(xiàn)，后面緊跟一條曼陀羅蛇，把蕭塵宇和身邊的侍衛(wèi)打得七零八落，小舞趁機(jī)攙著唐三逃走。玉小剛突然出現(xiàn)，讓唐三和小舞跟緊他，以免再遇到麻煩，小舞一心想回去救那只受傷的斑斕貓，玉小剛勸她趁早死心，他發(fā)現(xiàn)斑斕貓被曼陀羅蛇咬傷，就順著痕跡找到蛇的巢穴，讓唐三炮把蛇激怒，引到了蕭塵宇他們身邊，才讓唐三和小舞得以脫身。玉小剛覺(jué)得這條曼陀羅蛇很適合唐三，讓他把蛇殺死吸取魂環(huán)，小舞提出質(zhì)疑，唐三對(duì)玉小剛深信不疑。玉小剛想等蕭塵宇和蛇兩敗俱傷的時(shí)候出手，蕭塵宇和柳龍漸漸不敵，他們嚇得落荒而逃，曼陀羅蛇突然襲擊了玉小剛，玉小剛讓唐三出手殺蛇，唐三上下翻飛，使出暗器鐵釘襲擊蛇，結(jié)果被打翻在地，唐三使用紫金魔瞳刺瞎蛇的眼睛，然后再用鐵釘刺穿了蛇的喉嚨，曼陀羅蛇應(yīng)聲倒地死亡，頭頂上現(xiàn)出黃色的魂環(huán)，唐三知道這條蛇至少有400年的法