最近，都市里出現(xiàn)了一名專門襲擊長發(fā)女子的榔頭男，警方根據(jù)目擊者的通報(bào)找到了榔頭男的住所并在周圍展開了監(jiān)視，期間，有三個(gè)人陸續(xù)進(jìn)出過榔頭男的房間，他們分別是宅配快遞員、機(jī)車送貨員和披薩外送員，考慮到這可能是兇嫌所使用的調(diào)虎離山計(jì)，警方匆忙沖進(jìn)了他的房間，不想?yún)s發(fā)現(xiàn)一名疑似榔頭男的人倒在屋內(nèi)。

柯南回家后小蘭就告訴他，自從放寒假瑛祐就失去了聯(lián)系，而在此之前小蘭從他那里聽說，他好像在杯戶中央醫(yī)院找姐姐的時(shí)候發(fā)現(xiàn)了關(guān)于自己父親線索，柯南急忙找到茱蒂老師商量對策，并推斷出他的父親就是被黑暗組織殺掉的CIA諜報(bào)人員，隨后，柯南一行人趕到醫(yī)院向護(hù)士詢問英祐的事情，沒想到竟然還有另一個(gè)人像英祐一樣在這家醫(yī)院打聽水無憐奈的事情。

就在媒體哄作一團(tuán)采訪及川的時(shí)候，柯南獨(dú)自展開了調(diào)查，他從守畫室的門衛(wèi)那里得知了及川在案發(fā)前的小動(dòng)作，之后又在屋后發(fā)現(xiàn)了釣魚線，受到高木警官魔術(shù)的啟示，柯南破解了兇手的作案手法同時(shí)也得知了《青嵐》的所在，他利用老方法將小五郎麻醉并重現(xiàn)案發(fā)時(shí)的場景，最終將犯人繩之以法。案件了結(jié)以后，柯南雖戳破基德的偽裝，但這次他能抓到基德嗎？

小蘭興致勃勃的來到妃英理的律師事務(wù)所，試圖幫父母慶祝他們第一次約會(huì)紀(jì)念日，可妃英理卻在接了一通電話后匆匆離去，之后小蘭在一個(gè)大花瓶里發(fā)現(xiàn)了自己媽媽和陌生男人在一起的合照以及結(jié)婚戒指，氣憤的小蘭一路跟蹤到了一家咖啡館，卻看見妃英理正在和照片上的男人一起喝咖啡，就在小蘭想要揮舞拳頭沖向這個(gè)“外遇男”時(shí)，柯南的一句話打消了她的念頭。

柯南、少年偵探團(tuán)、哀、阿笠博士來到阿笠博士友人所在村莊觀光，在夜晚的溪邊等待放螢火蟲時(shí)，村長的兒子中嶺和助手垂水乘坐運(yùn)送螢火蟲的貨車到達(dá)。垂水打開貨車上的箱子，螢火蟲便成群結(jié)隊(duì)的飛了出來。元太為了要抓螢火蟲，爬上了貨車，隨手拿走了貨車上的手電。在大家陶醉于欣賞螢火蟲時(shí)，助手垂水接到一通中嶺打來的電話，說中嶺在烏帽巖，救命。柯南等人到達(dá)時(shí)，發(fā)現(xiàn)中嶺已經(jīng)死在車內(nèi)，地上放著疑似有毒的飲料瓶，車內(nèi)還飛著一只……螢火蟲。。。