博士請(qǐng)大家在一個(gè)叫Peach Sunny的咖啡店吃甜點(diǎn)，期間，在靠窗位置有兩個(gè)正在爭(zhēng)吵的人引起柯南的注意，就在博士剛趕到咖啡店時(shí)，突然沖進(jìn)了一輛卡車(chē)，撞死了坐在靠窗位置的那位先生，警方趕來(lái)后，得知死者叫相田，而和他一起的是大原企畫(huà)的社長(zhǎng)大原，意外發(fā)生時(shí)，大原正好去了廁所，所以才保住性命，這場(chǎng)看似意外的案件其實(shí)是有人蓄意殺害，那么，兇手是誰(shuí)？他又采用了什么樣手法？

為找尋更多的線索，服部向胴口詢問(wèn)起袴田與垂見(jiàn)之間的恩怨，不想他卻避而不答反而找來(lái)袴田教訓(xùn)服部，之后他又遇到了當(dāng)時(shí)在二館外的學(xué)生，據(jù)目擊人說(shuō)所，案發(fā)時(shí)他們?cè)吹揭粋€(gè)頭戴面具，身背護(hù)具袋的人進(jìn)出這里，聽(tīng)到這些證詞之后，服部終于知道了兇手是誰(shuí)以及他所使用的手法，而此時(shí)，柯南等人也趕到了比賽會(huì)場(chǎng)，聽(tīng)了警察對(duì)案情的描述之后，柯南急忙趕往服部所在的二館倉(cāng)庫(kù)，卻發(fā)現(xiàn)服部早已將兇手制服。

阿笠博士帶柯南和少年偵探團(tuán)去伊豆的海水浴場(chǎng)游玩，無(wú)意中聽(tīng)到了當(dāng)?shù)氐臐O夫下條和吉澤與新加入的漁夫荒卷的爭(zhēng)吵，雙方還約定晚上8點(diǎn)餐廳里見(jiàn)。但荒卷卻遲遲沒(méi)有出現(xiàn)最后被發(fā)現(xiàn)死在了沙灘上。在現(xiàn)場(chǎng)調(diào)查之時(shí)柯南發(fā)現(xiàn)船上留下的紐扣的疑點(diǎn)，而死者滿是劃痕的手機(jī)使柯南發(fā)現(xiàn)了犯人的真實(shí)名目，但是犯人的殺人動(dòng)機(jī)又是什么呢？

死者是奈緒子，柯南和服部在案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)發(fā)現(xiàn)了魚(yú)鱗和腳印，然而腳印的方向卻通向大海，只靠這些零星的線索，根本無(wú)法抓到兇手。這時(shí)，君惠說(shuō)她有今年祭典購(gòu)買(mǎi)號(hào)碼牌的名冊(cè)，于是柯南一行人前往神社，悲劇再次發(fā)生，君惠為找名冊(cè)死在倉(cāng)庫(kù)的大火之中。之后，柯南和服部分頭行動(dòng)，服部發(fā)現(xiàn)了新的線索，正巧此時(shí)柯南打來(lái)電話，他到底推理出了怎樣的真相而讓服部吃驚不已？上山找門(mén)脅時(shí)，和葉為救服部墜落懸崖，她能否化險(xiǎn)為夷？

正當(dāng)少年偵探團(tuán)在西多摩郡龍神山游玩之時(shí)，突然從山上墜落一輛汽車(chē)。雖然看似事故，在柯南的提示下警方判斷這個(gè)事件不是事故而是謀殺。光彥偷偷的從事故現(xiàn)場(chǎng)拿到寫(xiě)著暗語(yǔ)的紙條。從寫(xiě)著暗號(hào)的紙片入手，光彥，步美，元太3人一起來(lái)到了暗號(hào)所指示的地點(diǎn)，在這里他們發(fā)現(xiàn)了大量被盜的車(chē)輛和先前謀殺案的兇手。