少年偵探團(tuán)與白鳥(niǎo)警官在電影院偶遇，期間，他回想起了自己想要成為警官的理由，這時(shí)，一名叫笠倉(cāng)那海的小姐與大家相識(shí)，并且她與白鳥(niǎo)警官曾經(jīng)相識(shí)過(guò)女孩一樣，會(huì)用吸管包裝紙做成的花帶裝飾樂(lè)杯，難道她就是白鳥(niǎo)回憶中的少女？在聽(tīng)說(shuō)那海被跟蹤狂騷擾之后 ，大家一起前往她現(xiàn)居住的公寓 卻在發(fā)現(xiàn)她的男友橫尸家中，這是跟蹤狂犯下的命案嗎？還是這根本就是那海的自導(dǎo)自演？

就在萬(wàn)由美好不容易找到自己的身份的時(shí)候卻突然逃走了，而她遺失的紙條上寫(xiě)著“要知道真相就一個(gè)人來(lái)”的信息！而就在柯南追過(guò)來(lái)之后發(fā)現(xiàn)險(xiǎn)遭毒手的萬(wàn)由美。在眾人調(diào)查神社時(shí)得知萬(wàn)由美之前曾來(lái)過(guò)這里。晚上萬(wàn)由美又再次的險(xiǎn)遭綁架，但凡人卻留下了一份借條，借此柯南推斷出了犯人的身份，而所謂的好友的身份也最終暴露出來(lái)。

為了讓扭傷腳的柯南療養(yǎng)腳傷，大伙兒一起來(lái)到城崎溫泉，然而，小蘭卻突然失蹤，柯南從光彥他們所拍的照片上看到小蘭和一個(gè)小女孩在一起，同時(shí)照片上還出現(xiàn)了一個(gè)行蹤可疑的男人。這時(shí)，柯南他們遇到了服部，他受人委托前來(lái)找一個(gè)叫陽(yáng)菜的女孩，而她正是和小蘭在一起的那個(gè)孩子。據(jù)陽(yáng)菜的父親周平所說(shuō)，在陽(yáng)菜失蹤的同時(shí)他美術(shù)館里的展品彩虹之子也不翼而飛。就在大家四處進(jìn)行尋找時(shí)，陽(yáng)菜和小蘭遇到了危險(xiǎn)。

這天小五郎在賽馬之后來(lái)到小酒館巧遇了同樣賽馬的幾位同好。在屋外抽煙的小五郎遇到了來(lái)找他的小蘭和柯南，就在眾人回到小酒館時(shí)忽然發(fā)現(xiàn)酒館老板娘被刺身亡！在警方調(diào)查了酒館的幾位客人之時(shí)發(fā)現(xiàn)扇小姐為了挽救自己的舞蹈班向老板娘借錢(qián)的事實(shí)，而其他幾位客人也多少有把柄被老板娘抓住。柯南在勘察現(xiàn)場(chǎng)后發(fā)現(xiàn)了犯人的身份！

連續(xù)三年都會(huì)在生日時(shí)會(huì)收到恐嚇信的保科琉璍子，為了今年的生日會(huì)能夠順利舉行而邀請(qǐng)毛利作為保鏢。來(lái)到保科宅邸的小五郎眾人發(fā)現(xiàn)屋子里有著眾多的時(shí)鐘，而對(duì)于時(shí)鐘的準(zhǔn)時(shí)性屋子的主任琉璍子也似乎有著非常人的執(zhí)著。在參觀屋子的時(shí)候柯南眾人還得知了屋子以前發(fā)生的事故，就在生日宴會(huì)中剛剛吹熄蠟燭的琉璍子突然被刺身亡！