中忍考試第二場(chǎng)比賽開始了，搶奪旗幟戰(zhàn)的規(guī)則是在守住自家旗幟的同時(shí)進(jìn)攻敵陣，這場(chǎng)比賽將要淘汰半數(shù)的隊(duì)伍。第七班選擇博人駐守陣地，而巳月和佐良娜展開攻勢(shì)，讓他們沒想到的是敵方三人全都選擇進(jìn)攻，千鈞一發(fā)之際博人使用了科學(xué)忍具。得知兒子通過第二場(chǎng)比賽后鳴人非常高興，但他還不知道博人的作弊行為。

佐助等人朝著信的巢穴前進(jìn)，途中他們?cè)獾搅吮姸嗫寺◇w的攻擊，雖是克隆體但鳴人并沒打算下重手，在鳴人壓制克隆體時(shí)佐助與佐良娜先行一步援助小櫻。確定信沒有同伙后小櫻展開了攻勢(shì)，在和佐助匯合后信被完全壓制，所有的克隆體全部集中到了信的周圍，但他們做的第一件事竟然是殺死了信，在信不知道的情況下克隆體們實(shí)施著自己的計(jì)劃。

佐助這次帶回來的信息并不樂觀，去過輝夜之城的他遇到了兩個(gè)強(qiáng)大的對(duì)手，大筒木金式與大筒木桃式，擺脫兩人的攻擊后佐助立刻趕了回來。博人準(zhǔn)備去找父親理論的時(shí)候在門口撞見了佐助，想要打敗父親的博人打算拜佐助為師，但佐助開出的條件卻是讓他先學(xué)會(huì)螺旋丸。

佐良娜、博人、新希展開決賽混戰(zhàn)，佐良娜和博人聯(lián)手對(duì)抗新希攻防一體的忍術(shù)“黑鐵乃掌”，用雷遁手里劍攻擊新希卻傷不了對(duì)手分毫。新希反擊用黑鐵困住佐良娜和博人，佐良娜被黑鐵乃翼重傷倒地，博人為了證明自己使用科學(xué)忍具贏得比賽，鳴人親手揭穿兒子的作弊行為。幕后推手片助博士登場(chǎng)，博人意識(shí)到自己被人利用，隨后意想不到的人物出現(xiàn)了。

白夜團(tuán)利用民眾游行包圍了雷門公司，但他們真正的目的則是片助的科學(xué)忍具研究所。當(dāng)大家的注意力全被雷門公司吸引時(shí)白夜團(tuán)搶走了研究所的忍術(shù)資料，鹿臺(tái)意識(shí)到這一點(diǎn)后立即與博人等人趕了過去，他們依靠片助的跟蹤器找到了白夜團(tuán)，在同伴們的掩護(hù)下鹿臺(tái)和博人追了上去，他們能阻止白夜團(tuán)的陰謀嗎？