連續(xù)三年都會(huì)在生日時(shí)會(huì)收到恐嚇信的保科琉璍子，為了今年的生日會(huì)能夠順利舉行而邀請(qǐng)毛利作為保鏢。來到保科宅邸的小五郎眾人發(fā)現(xiàn)屋子里有著眾多的時(shí)鐘，而對(duì)于時(shí)鐘的準(zhǔn)時(shí)性屋子的主任琉璍子也似乎有著非常人的執(zhí)著。在參觀屋子的時(shí)候柯南眾人還得知了屋子以前發(fā)生的事故，就在生日宴會(huì)中剛剛吹熄蠟燭的琉璍子突然被刺身亡！

就在兇手企圖用球棒襲擊被騙到音樂室的小林老師時(shí)，他卻反過來被小林老師撂倒，這時(shí)，少年偵探團(tuán)和白鳥警官出現(xiàn)，原來小林老師早已被白鳥警官所保護(hù)而眼前這個(gè)人正是佐藤警官，期間，小林老師想起了以前在書店發(fā)生的事情，誤會(huì)消除的二人重歸于好。麒麟角是鈴木次郎吉在山中寺廟發(fā)現(xiàn)的寶物，而基德又以此為目標(biāo)出了預(yù)告函，次郎吉率領(lǐng)基德無法喬裝的少年偵探團(tuán)以及進(jìn)行直播的工作人員來到寺廟，麒麟像被藏在寺廟的立柱中間，想要拿取它并非易事……

解決了暗號(hào)事件回到日本的柯南終于恢復(fù)了正常的生活，在放學(xué)回家的路上元太提議大家進(jìn)入即將拆遷的大樓內(nèi)來玩捉迷藏。就在這時(shí)元太發(fā)現(xiàn)有奇怪的敲打墻壁的聲音，柯南發(fā)現(xiàn)這是有人發(fā)出的求救聲音，就在他們?cè)谒褜さ倪^程中發(fā)現(xiàn)了在檢查大樓的兩個(gè)工人。兩人告訴柯南他們那是他們發(fā)出的響聲不用在意但在柯南的推理下少年偵探團(tuán)們開始尋找被困的人，就在這時(shí)之前的檢查工人卻抓住了小哀，究竟應(yīng)該這應(yīng)該辦！

園子的次郎吉叔祖父要舉辦龍馬展，而怪盜基德則發(fā)出了預(yù)告狀。但奇怪的是這次基德發(fā)出的是歸還物品的預(yù)告狀！而從叔祖父那里園子他們了解到這次次郎吉只是借出了博物館場(chǎng)地，而展覽的主辦發(fā)則是樽見。為了對(duì)抗基德，幾次郎在展覽場(chǎng)地安排了特別“基德歸還處”就在眾人在處處提防怪盜基德的時(shí)候柯南發(fā)覺了基德指定的日期是雨天。但基德的用意究竟何在？

小蘭和小五郎按照指示來到了車站，就在這時(shí)阿波羅發(fā)現(xiàn)了在車站里奇怪的男人并得到了接下來的線索U字。之后小蘭一行來到了接下來的提示的瓷器店而這時(shí)阿波羅和母親一起離開剩下小五郎和小蘭繼續(xù)尋找線索。第二天在警方的要求下小蘭眾人繼續(xù)破解沒有完全解開的暗號(hào)，而就在眾人解開暗號(hào)來到會(huì)場(chǎng)之后，柯南發(fā)現(xiàn)賽場(chǎng)上的米奈芭有些不對(duì)勁！