當(dāng)晚，這名潛入醫(yī)院的黑暗組織同伙南田陸道果然展開(kāi)了行動(dòng)，但同時(shí)FBI也暴露了行動(dòng)，南田陸道在驅(qū)車(chē)逃跑的過(guò)程中舉槍自盡，雖然柯南破壞了他的手機(jī)但他還是通過(guò)其他手段將搜集來(lái)的信息傳給了組織。既然事情發(fā)展到這種地步，轉(zhuǎn)院無(wú)疑就是在向黑暗組織昭示水無(wú)憐奈就在這里，所以只能另想對(duì)策。另一方面，英祐伺機(jī)潛入了水無(wú)憐奈的病房，并發(fā)現(xiàn)她早已從昏迷中蘇醒。

茱蒂老師以卡梅隆搜查官女朋友的身份出現(xiàn)瞞過(guò)了木暮警官，這時(shí)，警方找到了一個(gè)裝有雨衣和兇器的紙袋并且還在死者的便簽本上發(fā)現(xiàn)了一句疑似死亡訊息的話，根據(jù)這些線索，就連第一個(gè)發(fā)現(xiàn)尸體的女秘書(shū)也成了懷疑的對(duì)象。另一方面，水無(wú)憐奈雖然重新回到黑暗組織，卻遭到組織的懷疑，為了證實(shí)她是否被FBI所籠絡(luò)，組織派給她一件任務(wù)，那就是殺掉赤井秀一。

小五郎、柯南和小蘭去鐮倉(cāng)看繡球花的時(shí)候遇見(jiàn)了一樁命案，死者是資產(chǎn)家矢口九衛(wèi)門(mén)，警方立刻聯(lián)系了死者的兒子祿郎、明彥和公夫，分別對(duì)他們進(jìn)行偵訊，發(fā)現(xiàn)每個(gè)人都有作案動(dòng)機(jī)和嫌疑，但他們卻有不在場(chǎng)的證明。死者的三個(gè)兒子不但沒(méi)有為父親的死感到悲傷反而因?yàn)檫z產(chǎn)分配問(wèn)題爭(zhēng)吵不休，看透真相的柯南將小五郎麻醉道出老先生的死因以及一個(gè)父親的哀傷。

為防止基德混入人群，次郎吉將所有人都隔離在防護(hù)網(wǎng)外，在眾粉絲表示不滿的同時(shí)，基德也宣告自己不會(huì)在如此冷清的舞臺(tái)表演，在他的煽動(dòng)下，粉絲們沖破包圍網(wǎng)。魔術(shù)表演開(kāi)始以前，他找到死對(duì)頭柯南并在他身上安裝了竊聽(tīng)器，一切準(zhǔn)備就緒，基德順利拿走了寶石鞋子，然而就在他通往樓頂?shù)耐局校雌扑查g移動(dòng)的柯南出現(xiàn)在樓頂……

柯南、小蘭和園子一起去醫(yī)院看望國(guó)中同學(xué)的時(shí)候，遇到了拿著照片四處詢(xún)問(wèn)的本堂英祐，照片上的人正是水無(wú)憐奈，但英祐卻堅(jiān)持認(rèn)為水無(wú)憐奈和姐姐是兩個(gè)人，于是，小蘭打電話給水無(wú)憐奈的超級(jí)粉絲庵野進(jìn)行確認(rèn)，沒(méi)想到對(duì)方竟然說(shuō)她打錯(cuò)了，隨后一行人來(lái)到庵野家，他的母親正準(zhǔn)備出門(mén)取錢(qián)，柯南察覺(jué)到事有蹊蹺，斷定讓她打錢(qián)的那個(gè)人根本就是詐欺犯，在大家的幫助下，詐欺犯被送往了警局，而尋找水無(wú)憐奈也進(jìn)入了正題。