從現(xiàn)場調(diào)查回來以后，柯南已經(jīng)知道了兇手的犯案手法并且還找到了決定性的證據(jù)，萬事俱備，柯南用花言巧語讓小五郎做了特別辯護(hù)人，開庭前柯南還在妃英理面前重現(xiàn)殺人手法。妃英理和九條的對戰(zhàn)再度打響，柯南本想讓小五郎自己發(fā)揮，可他卻越幫越忙，于是，柯南以慣用手法將他麻醉，在法庭上揭露真兇。

眼看車子馬上到達(dá)賢橋車站，但與黑色組織接觸之前，柯南還要先處理一件事情，那就是揭穿車上的這兩名珠寶大盜，將他們制服以后，柯南讓阿笠博士報警，而自己則只身犯險進(jìn)入車站，他將碟片和支票都放在儲物柜里，自己躲在一邊暗中觀察，當(dāng)沃克拆除碟片時，今恩出現(xiàn)，他看出了柯南想要收集他們指紋的目的并推斷出他就在附近，于是便開始尋找，只聽兩人腳步漸漸逼近……

與黑色組織面對面 滿月之夜的兩起神秘事件(之三)卸掉偽裝后，工藤新一出現(xiàn)在滿月之下，在眾賓客吃驚之余，他也開始了對整件案子的推理。他首先排除了木乃伊的嫌疑，并利用搜集來的線索一步步的將真兇以及他的手法公之于眾，沒錯，兇手確實與小五郎一組，他就是……另一方面，看到灰原被茱蒂帶走，新出醫(yī)生便尾隨其后，車子一直開到碼頭，茱蒂下車揭露出他的真實身份，而這個人就是寄信給柯南和小五郎同時也是她殺父仇人的蓓摩特。

爆炸接二連三的發(fā)生，必須要快點(diǎn)抓住歹徒，于是少年偵探隊又仔細(xì)看了一遍錄影帶，然而依然沒有任何收獲，柯南不得不重新思考并試圖去揣摩歹徒的心理，這時，他好像突然想到了什么便沖出警局直奔光彥當(dāng)時拍攝時所站的郵筒，確定了自己的推測后，柯南讓少年偵探隊找到附近其他的郵筒，這起爆炸案到底和郵筒有什么關(guān)系？

小五郎帶著小蘭和少年偵探團(tuán)的孩子們來到被稱為地球遺產(chǎn)的人造木屋的集落·鬼澤鄉(xiāng)去觀光。這個村莊里最近流傳著小孩幽靈的傳言。而到了夜里，柯南他們?yōu)榱舜_認(rèn)幽靈而出去散步的時候，步美卻和少女幽靈相遇了暈了過去！而對于步美的發(fā)現(xiàn)村子里的人卻極力否認(rèn)，到底是幽靈少女還是真有其人？