妖怪倉(cāng)庫(kù)是把貴重的物品放進(jìn)里面就會(huì)立刻消失的倉(cāng)庫(kù)，少年偵探團(tuán)為了弄清真相決定一探究竟，元太他們?yōu)榱俗尶履下冻鰺o(wú)話可說(shuō)的表情而干勁滿滿。在調(diào)查了倉(cāng)庫(kù)內(nèi)部之后，柯南只看到了地板上留下的零星腳印和嵌在墻上的大算盤，除此之外別無(wú)他物。但從外面的天窗向里面看的話，就能看到堆積如山的寶物，可意外的是當(dāng)再次打開(kāi)倉(cāng)庫(kù)的門時(shí)，里面的寶物就全都消失不見(jiàn)，柯南提出的天花板和地板機(jī)關(guān)的猜想被光彥等人否認(rèn)，難道妖怪倉(cāng)庫(kù)真的存在？

阿笠博士和少年偵探團(tuán)在河灘看螢火蟲的時(shí)候，垂水打電話給運(yùn)來(lái)螢火蟲的中嶺，不想電話的另一邊卻傳來(lái)痛苦的呻吟聲，于是大伙兒匆忙驅(qū)車趕往事發(fā)地點(diǎn)，到達(dá)時(shí)中嶺已經(jīng)在自己的車子里停止了呼吸，在他的旁邊還有一瓶有毒的飲料，有四人具有犯案嫌疑小和田道武以及他的女兒小葵、垂水和達(dá)馬，就在鳴龍梳理案情時(shí)，柯南注意到了元太從垂水車上拿的手電筒，這正是破案的關(guān)鍵！

雖然根據(jù)收據(jù)知道了這13件t恤是在每個(gè)周日的12：28所購(gòu)買的物品，但專柜的銷售員卻不記得購(gòu)買人的長(zhǎng)相，與此同時(shí)，柯南從t恤上奇怪的折痕調(diào)查出了十多年前的登山家遇難事故，而這似乎與這起爆炸事件有特殊的關(guān)聯(lián)，就在人質(zhì)們開(kāi)始躁動(dòng)的時(shí)候，柯南將小五郎麻醉，并指出了放置炸彈的幕后黑手，而他就是……

服部把和葉的護(hù)身符錯(cuò)交給了國(guó)末照明，為了要回裝有服部照片的護(hù)身符，二人到東京。他們找到國(guó)末的朋友并隨他來(lái)到一家運(yùn)動(dòng)咖啡館，不想國(guó)末卻在廁所里被人毆打昏迷不醒。于是，柯南、服部和高木警官一起展開(kāi)調(diào)查，他們把嫌疑人的范圍縮小到三個(gè)人，并推斷國(guó)末白天觀看的比賽和這起事件有密切關(guān)系，可是他看的到底是什么比賽？這三個(gè)嫌疑人的證詞中又隱藏著什么線索？

小五郎應(yīng)“草莓雙人組”中藤森朝子之邀前來(lái)參加她的慶生會(huì)，沒(méi)想到開(kāi)門的朝子小姐竟然一臉驚恐滿身是血的出現(xiàn)在小五郎面前，她說(shuō)有人突然闖入屋內(nèi)向她發(fā)動(dòng)襲擊，進(jìn)屋后，柯南發(fā)現(xiàn)了一具頭戴僵尸面罩的的尸體，而這個(gè)人正是朝子小姐的搭檔今岡次郎，警方把這起案件初步斷定為正當(dāng)防衛(wèi)，但柯南卻察覺(jué)到這是一起蓄意謀殺案！