女主播水無憐奈拜托小五郎調(diào)查一件奇怪的事情，她家的門鈴連續(xù)兩個(gè)月無故響起，但卻從未發(fā)現(xiàn)有任何人出現(xiàn)在附近的跡象，并且門口還曾出現(xiàn)過一瓶安眠藥，更離奇的是隔壁空了半年的房子竟然在某天夜里出現(xiàn)了聲響，聽完水無的描述，柯南在她家門口的墻上粘了發(fā)信器，企圖竊聽門外的動(dòng)靜，之后，又獨(dú)自來到隔壁房間調(diào)查并在玻璃門上發(fā)現(xiàn)了“木、美、和”三個(gè)字。

小五郎在樓下喝咖啡時(shí)，看服務(wù)員祥子心事重重的樣子，詢問得知，一個(gè)一直給她發(fā)MAIL的小男孩小滿，今天突然給她發(fā)了四封奇怪的訊息，想到小滿可能遇到危險(xiǎn)，大家都十分擔(dān)心，可當(dāng)務(wù)之急是確定小滿的位置，根據(jù)祥子提供的線索，柯南把目標(biāo)鎖定在中洗、久更津和枯前崎三個(gè)地方，但打電話過去詢問卻并未查到他們的蹤跡，小滿到底出了什么事情？

與黑衣組織的戰(zhàn)斗告一段落，又回到了平靜的生活。某天，少年偵探隊(duì)獲知同樣就讀帝丹小學(xué)的雨宮翔子突然消失，據(jù)說她和灰原十分相像，莫非黑衣組織的魔爪已經(jīng)深入學(xué)校？為找到翔子，放學(xué)后大家展開了調(diào)查，期間還遇到神色可疑的老師，之后一行人找到了翔子失蹤前來過的便利店，并得知她在這里買了飲料、牛奶和小刀片，就在柯南他們百思不得解時(shí)，由美出現(xiàn)……

警方在露天澡堂里找到了殺死兩人的兇器神刀以及一條沾有血跡的浴巾，隨后警察又對(duì)旅館里有犯案嫌疑的人逐一進(jìn)行偵訊，柯南也獨(dú)自展開了調(diào)查，他雖然發(fā)現(xiàn)了安西繪麻死亡現(xiàn)場(chǎng)雪的深度有所不同，但還是不能解開為何只留下了一串腳印的謎題，就在這時(shí)電視上的滑雪大賽給了他啟發(fā)，如果兇手采用那種手法，那么，這一切謎題也就迎刃而解。

由于服部贏得了推理比賽，所以和葉不得不妥協(xié)去和柯南、小蘭等人一起去甲子園球場(chǎng)觀看全日本高中棒球賽，這里不僅因聚集了來自全國(guó)的各地的棒球精英而名聲大噪，還有四百三十顆翠綠的常春藤也讓人賞心悅目。比賽剛開始就讓全場(chǎng)的觀眾熱血沸騰，然而就在這樣熱情的氛圍之下，似乎有著什么不可知的危機(jī)正慢慢靠近……