大名鼎鼎的巽律師找小五郎來(lái)酒店談事情，他希望小五郎可以找到自己妻子外遇的證據(jù)。晚上，小五郎等人經(jīng)過(guò)巽律師家時(shí)，看到有好多警察，原來(lái)是巽太太被人謀殺，柯南在現(xiàn)場(chǎng)發(fā)現(xiàn)了訂書(shū)針，而嫌犯最大的就是巽律師，可是兇案發(fā)生時(shí)他正和小五郎在一起，擁有完美的不在場(chǎng)證明，柯南決定重回酒店開(kāi)始調(diào)查，洗衣輸送管，酒店鬧鈴聲還有訂書(shū)針，將這些串在一起，真相只有一個(gè)。

工藤新一與毛利蘭搭公車(chē)時(shí)，碰到色狼澤田治對(duì)小蘭毛手毛腳。小蘭馬上大喊色狼，而且還追澤田追下車(chē)。后來(lái)小蘭與新一分頭追人，好不容易才抓到澤田。正當(dāng)要將澤田扭送警局時(shí)，看到一名因?yàn)楹粑魍Ｖ苟∏槲＜钡睦先藢m野勝代被送到醫(yī)院，而刑警佐藤美和子等人則是懷疑這可能不是意外，而正在詢(xún)問(wèn)勝代的看護(hù)山下誠(chéng)...

柯南和小蘭在參加天下第一夜祭時(shí)碰到了作家世井，他讓小蘭幫忙拍了幾張照片，這時(shí)，橫溝警官找到世井說(shuō)他的朋友今竹被殺，大家一起趕往犯罪現(xiàn)場(chǎng)，期間，世井用自己的文稿代替今竹的交給了《文藝時(shí)代》的記者，種種跡象表明世井就是兇手，可讓人棘手的是此人有不在場(chǎng)證明——相機(jī)里那些照片，仔細(xì)推敲后柯南發(fā)現(xiàn)了其中的破綻。

身體變小后柯南轉(zhuǎn)入帝丹小學(xué)，并結(jié)識(shí)了步美、光彥和元太。某日，明星洋子來(lái)到毛利偵探事務(wù)所，說(shuō)總感覺(jué)有人暗中監(jiān)視她，為了更進(jìn)一步了解真相，毛利一行人來(lái)到洋子住處，可開(kāi)門(mén)后居然有具死尸橫在門(mén)口，期間柯南發(fā)現(xiàn)了另一名演員優(yōu)子的耳環(huán)并且還注意到洋子的經(jīng)紀(jì)人山岸神態(tài)怪異，洋子、山岸、優(yōu)子到底誰(shuí)才是真正的兇手。

柯南和伙伴們?nèi)ッ佬g(shù)館時(shí)撿到了一張畫(huà)有奇怪符號(hào)的紙，大家自行成立少年偵探團(tuán)去調(diào)查這些暗號(hào)，按照符號(hào)的指示先到達(dá)東京塔，在周?chē)归_(kāi)偵查卻一無(wú)所獲，休息的時(shí)候步美的新發(fā)現(xiàn)為柯南找到破解暗號(hào)的出口，大家一路尋找從東京鐵塔到南部水族館的標(biāo)記，然而，事情并非那樣順利，柯南能破解暗號(hào)嗎？暗中跟蹤少年偵探團(tuán)的黑衣人又是誰(shuí)？