利用步美找到的暗號解讀表，柯南本以為能順利解開暗號，不料卻遇到了瓶頸。正當此時，若狹老師再次拜托少年偵探團前往舊倉庫尋找石灰。來到舊倉庫的眾人發現倉庫一片狼藉，在若狹老師不經意的提示下，柯南終于解開了暗號的含義，并推測犯人將再次來到舊倉庫。為了避免打草驚蛇，柯南設計誤導犯人，并在深夜與若狹老師等人再次來到舊倉庫，柯南能否順利將犯人一網打盡？

米小圈的班級成功被當選為文化交流班，這意味著一群藍眼睛黃頭發的卷毛將要和米小圈所在的同學相處幾天，同學們第一次接觸外國小朋友，都是滿滿的好奇心。課間十分鐘，同學們便在操場上做才藝展示，外國友人給鐵頭他們展現了剛剛學到的中國武術拳法，鐵頭看得津津有味。該中國小朋友上場了，鐵頭給他們表演了太極拳，太極柔中有剛，出神入化，藍眼睛們也看得入了迷。這次國際交流，不僅僅讓同學們大開眼界，連肌肉老師也非常好奇，來學校的體育老師是個金發碧眼又高挑性感的女性，肌肉老師看到她在拿體育器材，立刻上前幫忙，誰知卻不小心將外籍友人的裙子給刮破了，他非常緊張，立刻將自己的外套脫下來給金頭發，但是對方毫不在意，直接將裙子順勢扯成另外的款式，原來他們在裙子里也有穿內襯，根本不打緊，金頭發將裙子的布片做成絲帶綁在頭上，肌肉老師既佩服又欣賞。按照教材大綱的要求，肌肉老師將調高的桿子放在了標準高度，但是金頭發根本沒有在乎教材的標準，直接提到最高，肌肉老師看到金頭發很颯爽地跳過去，他炫耀著一陣緊實的肌肉正要大顯身手，忽然被跳桿給絆倒了，眾目睽睽下輸給了外國友人，竟然還是個女同志，肌肉老師非常難為情，強忍眼淚跑回到辦公室。阿爾

柯南所在的班里來了一位新老師名叫若狹留美，若狹老師想在體育課前用石灰畫線，卻發現石灰已經用完了。柯南告訴若狹老師舊倉庫里可能有石灰，元太和光彥開玩笑說舊倉庫有幽靈出沒，若狹老師感到很害怕，便拜托少年偵探團一同前往舊倉庫。在尋找石灰的過程中，柯南發現一扇通往地下的門，眾人合力打開門后，卻驚人地發現了一具骸骨……

小五郎讓柯南和小蘭陪他一起去位于大分的別府溫泉旅行，說到別府溫泉最有名的莫過于地獄巡游之旅，就在小蘭和柯南興致勃勃討論的時候小五郎卻在一旁默不作聲。在柯南和小蘭的逼問下小五郎才說出了實情，這次的旅行目的是尋找仲代電氣社長的女兒麻奈美，柯南根據照片找到了麻奈美所住的旅館，但這僅僅只是開始。

毛利一家大早上就來到了白羅咖啡廳，安室特制的蛋糕是店里的招牌，但打開冰箱后卻發現蛋糕融化了。少年偵探團聽到柯南在白羅咖啡廳便全跟了過來，得知蛋糕融化后他們都很失望，為了讓伙伴們吃到安室的蛋糕柯南準備著手調查此事，經過了幾天的監控他們并沒有找到原因，這起蛋糕融化事件的真相到底是什么？