無(wú)法渡海，大家只能暫時(shí)待在鎮(zhèn)長(zhǎng)家的廢棄別墅里，然而干坐在這里等救援還不如對(duì)這棟房子進(jìn)行一番調(diào)查，于是 ，大家就分組行動(dòng)，柯南和服部等人在一樓的房間里發(fā)現(xiàn)了鎮(zhèn)長(zhǎng)和他女兒的照片以及房梁上一些莫名其妙的文字，突然間，二樓傳來(lái)慘叫，久米不知為何在看到鎮(zhèn)長(zhǎng)女兒的肖像油畫(huà)后就變的很反常，這時(shí)，救援船趕來(lái)，可船上卻只有一具船長(zhǎng)的尸體和一行字句，事情變得越來(lái)越奇怪了。

小五郎受邀帶著柯南與小蘭造訪知名畫(huà)家早河靜山的別墅。他的地址黑木次郎拜托小五郎激勵(lì)自殺未遂的靜山。次日，小五郎等留下靜山和黑木去海邊釣魚(yú)，而傭人山本典子聯(lián)系他們說(shuō)靜山留下手書(shū)失蹤了。很快，在竹林中發(fā)現(xiàn)了靜山的遺體。發(fā)覺(jué)自殺有可疑之處的柯南剖析事件真相發(fā)現(xiàn)他殺的證據(jù)和犯人的真實(shí)身份！

平次，葉子終于安全到達(dá)小五郎的事務(wù)所，五人在吃飯的時(shí)候說(shuō)道最近都內(nèi)發(fā)生了連續(xù)發(fā)火事件，現(xiàn)場(chǎng)總會(huì)留下紅色的馬的人偶。次日，柯南等人造訪委托他們的諸角宅邸后亮子也以可能是自己多疑了為由放棄了委托。而在柯南他們監(jiān)視的過(guò)程中遇到了風(fēng)水師曾我和亮子的沖突。就在柯南眾人回去之后又再次發(fā)生了火災(zāi)而地點(diǎn)正是亮子的住處。

小蘭在英語(yǔ)課上開(kāi)小差后被老師朱蒂發(fā)現(xiàn)，看到了『×』的標(biāo)記，但卻不知其意。放學(xué)后，園子同朱蒂與柯南一起去咖啡店。突然大廈內(nèi)停電，咖啡店邊的電梯發(fā)現(xiàn)男性的尸體。是誰(shuí)被殺了，而在死者隨身帶著的資料帶上有用血書(shū)寫(xiě)的『○×△』又有什么意思？是被害者留下的暗示嗎，柯南發(fā)現(xiàn)死亡信息的不同之處，是否解開(kāi)了死亡信息的謎題？

柯南和小蘭跟著小五郎來(lái)到關(guān)門海峽，還在這里認(rèn)識(shí)四個(gè)高中時(shí)代就是同學(xué)的年輕人，沒(méi)想到第二天，他們的另外一名高中同學(xué)真尾被人發(fā)現(xiàn)橫尸關(guān)門橋下，起初警方懷疑兇手就在與死者見(jiàn)過(guò)面的那四名同學(xué)中，然而他們都有不在場(chǎng)證明，偵訊過(guò)后四個(gè)人都擺脫了嫌疑，但柯南卻發(fā)現(xiàn)了破綻。