七年前載滿相當(dāng)于十億日元金子的竜神號(hào)，突然出現(xiàn)在敷島海面。以幽靈船為噱頭的村長三上邀請(qǐng)小五郎來演講，而他的真正目的是拜托小五郎找到金子的所在。演講時(shí)，小五郎差點(diǎn)喪命講臺(tái)，兇手很有可能是島上的守衛(wèi)浜田，和旅行社職員上原，兩人也似乎是舊識(shí)。當(dāng)晚小五郎一路追蹤襲擊他的武士，卻被人打暈掉入了兇手的陷阱，成了殺害浜田的兇手。

高中生偵探工藤新一與毛利蘭、鈴木園子，一起到電影導(dǎo)演永田彰宏的別墅玩。當(dāng)永田以指導(dǎo)演技為理由，與新進(jìn)女演員沙織熱吻時(shí)，永田的妻子，同樣也是知名女演員的知里突然現(xiàn)身，而且還突然打了沙織一巴掌，於是兩人開始產(chǎn)生激烈口角。為了要緩和氣氛，永田邀請(qǐng)大家一起喝紅茶...

柯南、小五郎和小蘭驅(qū)車去北海道看丹頂鶴，偶然認(rèn)識(shí)了飼養(yǎng)丹頂鶴的大伯，他邀請(qǐng)柯南他們?nèi)プ约杭胰胱。蟛牡艿馨⒈崆檎写麄儯驮谶@個(gè)時(shí)候大伯的兒子阿浩和女兒則子為財(cái)產(chǎn)的事兒而來。之后，柯南等人一起去泡了溫泉，回到屋子的時(shí)候發(fā)現(xiàn)大伯被人用十字弓射殺，而阿浩則跑去警局自首，但柯南依據(jù)自己對(duì)現(xiàn)場的勘查認(rèn)為兇手另有其人。

柯南注意到這些音符并將其解讀，這時(shí)，當(dāng)?shù)氐睦暇煺f倉庫里有麻生圭二留下來的樂譜，這種重要線索柯南自然不會(huì)放過，他和警察一起去找樂譜，而這期間，一直精神怪異的西本上吊死亡，腳下還留有遺書，柯南推斷出這是他殺，當(dāng)在看到麻生圭二留下來的樂譜后，柯南斷定出了兇手，他利用變聲領(lǐng)結(jié)和廣播室說出真相。

小五郎和他的大學(xué)同學(xué)在弁慶溫泉旅館舉辦柔道社同學(xué)會(huì)，參見的人都是小五郎的死黨，大家一時(shí)興起決定在煙火大會(huì)開始前打桌球消磨時(shí)間，只有由美一人回房休息，煙火大會(huì)開始前朋友們考慮到由美的脾氣，便沒去打攪她休息，結(jié)束后，大家一起去由美的房間，發(fā)現(xiàn)的卻是由美舉槍自盡的尸體，經(jīng)過檢查發(fā)現(xiàn)由美死于下午三點(diǎn)左右，也就是大家一起打桌球的時(shí)候。