紀曉嵐與和聯手派人護送御醫呂長安安在回京，這對多年來的冤家對頭即使在相互合作時也不忘反唇相譏，彼此嘲謔。 從呂長安之口，眾人才知四姑娘與十四王爺乃是藥方奇案的罪魁禍首，眼前紙包不住火，陰險毒辣的十四王爺決定丟卒保車，要四姑娘刺殺紀曉嵐后再自殺，以消滅罪跡，眼見自己忠心耿耿追隨的人竟如此冷酷無情，四姑娘徹底絕望，將一劑毒藥一飲而盡。 紫禁城內，皇上召見文武百官，和得意洋洋肆意表功，紀曉嵐巧設圈套，使和、福康安挪用貢品的不義之舉和此后協助自己調查藥方密案的合作之功一一道出，搞得二人一驚一乍。 十四王爺應召入宮見駕，藥方奇案終于到了真相大白的時候。

紀曉嵐夜讀時又接到被扔進窗子的紙條，上面寫有郭天的消息，紀曉嵐懷疑黑衣人正是張了了。紀曉嵐夜探郭天，得到通報的和珅與盧焯眼見沒有退路，只得慌忙扮成囚犯躺在隔壁囚房。乾隆看到瑤琴乘坐的馬車很是欣喜，不料落入盧安的圈套，也被一同押走。乾隆三人被關在洞中，外面重兵把守。乾隆佯裝自殺以騙過盧安，再見機救出瑤琴。紀曉嵐終于醒悟，誓要擺脫情感糾葛，全力調查國庫虧空一案。紀曉嵐扮作江湖郎中，偶遇掌管賬本的宋司庫，以自己掌握的情況博得宋司庫信任，并抓住其惶恐的心理，以消災為由取得真賬本。和珅模不透紀曉嵐葫蘆里賣的是什么藥，便決定先下手為強，命盧安將瑤琴押回杭州以要挾郭天認罪，卻沒料到乾隆在盧安即將動身時救出瑤琴。

和危言聳聽，恐嚇與利誘兼施，幸紀曉嵐及時趕到，將小月帶離和府。 皇上怪罪紀曉嵐尋人不利，要將他押往午門問斬，一直躲在閱微書房的莫愁被迫現身出面，紀曉嵐趁機要求金鸞殿上的皇上給莫愁名份，從此可以清清白白做人。但滿漢通婚，大清法律本不應允，要通過太后首肯，豈是易事！何況又有和等煽動一些大臣，尋隙報復，百般刁難。太后以祖宗之法罰，皇上表跪思過，患得患失之后，皇上決定讓步。 豐紳殷德一身武裝，將赴邊疆征戰。臨行之前，與軍豪剖白心跡。兩人相約，半年之內，均不談婚論嫁，建功立業后，再贏得小月芳心。 三姑自作多情，一心想與孑然一身的紀曉嵐成雙作對，害得一向無所畏懼的紀大人是心驚肉跳，避之不及。不出半年，豐紳殷德凱旋歸來，小月欣然坡門相迎，不想他已雙目失明。

一對新人正要行互拜之禮，和圣旨破門而入；軍豪因蔑視格格被革去狀元名號。遭受這猝然打擊的軍豪精神恍惚，負氣而去。 對和的無恥卑劣，紀曉嵐憤慨不已，與之展開雄辯。正吵得難分難解。憂心忡忡的皇上來了，原來找遍京城依然不見莫愁蹤影。皇上強令紀曉嵐限期之內將莫愁找否則便要把小月許配給豐紳殷德。 軍豪落魄，無故遭衙役歐打，富有正義感的豐紳殷德挺身而出，二人結為莫逆之交。和迫不急待，送上聘禮，小月見了怒不可遇，將其轟出門外。紀曉嵐鼓勵軍豪、小月離開京城，到別處過平凡人生。軍豪不忍使紀大人落到“抗旨欺君”的地步，堅決不從。思前想后，小月決定犧牲自己，屈從于和家的這門婚事，以報答紀曉嵐幾年來對自己的恩德。

湘云出行未遠，即被書商陳未元劫持，原來二人本是夫妻，陳未元貪圖謀利，視“紅樓”奇貨可居，來日待價而沽。湘云曾為曹雪芹校訂書稿，深知其中三味，愛書心切，惟恐被毀，攜之東躲西藏，夫妻反目成仇。看來要使《紅樓夢》得見天日，只能借助于皇上了，紀曉嵐遣皇差向遠在泰安的皇上獻上了幾冊散裝的書稿，易名為《石頭記》，請太后、皇上消遣閱讀。或許是旅途苦悶，太后讀后愛不釋手，連下八百里文書，催要下文。 莫愁搭救湘云，私闖陳宅，被福康安擒拿，紀曉嵐借口自己與莫愁、湘云等俱是《石頭記》作者，必須共同合作，才能盡早把續書寫出，交太后的差。在皇帝近侍藍侍衛的陪同下，名正言順地解救了莫愁、湘云，并再次拿到了“紅樓”書稿。 紀曉嵐以一堆白紙偽稱書稿，交官差千里迢迢，進獻急不可待欲知下文的皇上及太后。陳未元對紀曉嵐恨之入骨，慫恿福康安在紀曉嵐裝訂書稿時來一個人臟俱獲。